典型文献
基于高通量测序对IgA肾病肠道菌群生物学特征的初探
文献摘要：
目的:研究IgA肾病（IgA nephropathy, IgAN）患者肠道菌群结构及多样性的特点，探讨IgAN患者肠道微生物与临床指标及肾脏病理的相关性。方法:回顾性选择包头医学院第一附属医院2020年5月至2020年9月IgAN患者15例作为IgAN组，健康家属8例和健康体检者7例作为健康对照组。采用Illumina高通量测序技术对粪便样本中所有细菌的16S rDNA-V4区进行DNA测序，使用QIIME2分析流程对原始序列进行处理、分析，与Greengenes（v138）数据库进行对比，调用DADA2软件包对数据进行去噪，相当于以100%的相似度聚类（OTU是以97%的相似度聚类）。采用PCoA主坐标分析法分析肠道菌群结构及多样性，以Spearman相关分析法或Pearson相关分析法分析差异性菌群与肾脏病理和临床指标的相关性。结果:（1）健康对照组和IgAN组肠道微生物Beta多样性差异具有统计学意义（
P=0.010）。（2）与健康对照组比较，IgAN组患者肠道菌群物种数目在1个门、3个科和22个属水平显著增加。与健康对照组比较，在门到科水平内，IgAN患者厚壁菌门（Firmicutes）及瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）物种数目减少，绿屈挠菌门（Chloroflexi）及盖勒菌科（Gaiellaceae）、葡萄球菌科（Staphylococcaceae）和Family-XⅢ科物种数目增加（均
P<0.05）；在属水平，IgAN患者舌下肌菌属（
Subdoligranulum）物种数目显著减少（
P=0.020），而活泼瘤胃球菌属（
Ruminococcus-
gnavus-
group）物种数目显著增加（
P=0.004）。（3）在门水平，IgAN患者厚壁菌门物种数目与血白蛋白（
r=0.637，
P=0.003）、IgG（
r=0.452，
P=0.046）呈正相关，芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）物种数目与血肌酐呈负相关（
r=-0.453，
P=0.045），疣微菌门（Verrucomicrobia）物种数目与IgM呈负相关（
r=-0.450，
P=0.046），杆菌门（Patescibacteria）物种数目与IgA呈正相关（
r=0.469，
P=0.037）。在属水平，IgAN患者活泼瘤胃球菌属（
r=-0.614，
P=0.004）和巨单胞菌属（
Megamonas）（
r=-0.451，
P=0.042）物种数目与血白蛋白呈负相关；舌下肌菌属物种数目与血白蛋白呈正相关（
r=0.563，
P=0.009）；戴阿利斯特杆菌属（
Dialister）物种数目与补体C3呈负相关（
r=-0.427，
P=0.041），与IgA呈正相关（
r=0.434，
P=0.035）；韦荣菌属（
Veillonella）物种数目与估算肾小球滤过率呈正相关（
r=0.452，
P=0.043）。艾森伯格菌属（
r=-0.850，
P=0.007）、霍尔德曼菌属（
r=-0.845，
P=0.008）、
Flavonifractor（
r=-0.845，
P=0.008）、葡萄梭状芽孢杆菌属9（
r=-0.845，
P=0.008）物种数目与牛津病理分型中肾小球节段性硬化或粘连（S）呈负相关，
Fusicatenibacter物种数目与系膜细胞增多呈负相关（
r=-0.845，
P=0.008），而粪球菌属2物种数目与S（
r=0.738，
P=0.037）和肾小管萎缩或间质纤维化（
r=0.756，
P=0.030）呈正相关。（4）以活泼瘤胃球菌属和舌下肌菌属建立随机森林模型，拟合后受试者工作特征曲线下面积为0.927。
结论:IgAN患者和健康对照的肠道菌群具有差异性，IgAN患者肠道菌群的变化与其临床指标和肾脏病理相关，尤其活泼瘤胃球菌属和舌下肌菌属可能在IgAN中发挥了重要作用。
文献关键词：
肾小球肾炎，IgA;胃肠道微生物组;粪便;Illumina高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
樊晓敏;米焱;王彩丽
作者机构：
包头医学院第一附属医院肾内科，包头 014010
文献出处：
引用格式：
[1]樊晓敏;米焱;王彩丽-.基于高通量测序对IgA肾病肠道菌群生物学特征的初探)[J].中华肾脏病杂志,2022(02):91-99
A类：
Greengenes,v138,盖勒,Gaiellaceae,Staphylococcaceae
B类：
肾病,群生,生物学特征,nephropathy,IgAN,肠道菌群结构,临床指标,肾脏病理,性选择,包头,家属,健康体检者,Illumina,高通量测序技术,粪便样本,16S,rDNA,V4,QIIME2,调用,DADA2,软件包,去噪,相当于,OTU,PCoA,主坐标分析,相关分析法,Beta,物种数,厚壁菌门,Firmicutes,瘤胃,Ruminococcaceae,Chloroflexi,Family,舌下,Subdoligranulum,活泼,Ruminococcus,gnavus,group,血白蛋白,IgG,单胞菌,Gemmatimonadetes,血肌酐,Verrucomicrobia,IgM,Patescibacteria,Megamonas,阿利斯,利斯特,Dialister,补体,C3,韦荣菌,Veillonella,估算肾小球滤过率,伯格,霍尔,尔德,德曼,Flavonifractor,梭状芽孢杆菌,芽孢杆菌属,牛津,病理分型,节段性,粘连,Fusicatenibacter,系膜细胞,粪球,肾小管萎缩或间质纤维化,随机森林模型,受试者工作特征曲线,特征曲线下面积,病理相关,肾小球肾炎,胃肠道微生物组
AB值：
0.312591
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