典型文献
长链非编码RNA GIHCG在胆管癌组织中表达及其临床意义
文献摘要:
目的:通过分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库,筛选胆管癌预后相关长链非编码RNA(lncRNA)GIHCG,检测其在胆管癌组织中的表达水平,探讨其临床意义。方法:使用R语言的limma包分析TCGA中31例胆管癌组织和9例癌旁组织的数据,后用survival包及survival ROC包筛选与患者生存相关的差异基因表达lncRNA。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)和免疫荧光原位杂交技术(FISH)检测lncRNA的表达水平,分析其与患者临床特征的相关性。采用小干扰RNA敲低lncRNA GIHCG表达水平,通过Transwell检测其对胆管癌细胞系迁移能力的影响。结果:共筛选到2 970个差异表达lncRNAs,其中上调1 852个,下调1 118个。生存分析、受试者工作特征(ROC)曲线[显示lncRNA GIHCG、ROC曲线下与坐标轴围成的面积(AUC)值最大,为0.684]及与临床资料的相关性分析结果表明,lncRNA GIHCG表达与胆管癌患者淋巴结转移具有明显相关性, P<0.001。lncRNA GIHCG在胆管癌组织中的表达显著升高,与肿瘤大小和淋巴结转移密切相关。Transwell实验结果表明,lncRNA GIHCG可促进胆管癌细胞的迁移。 结论:lncRNA GIHCG的表达水平在胆管癌组织中显著升高,且与患者生存、淋巴结转移密切相关,有望成为新的胆管癌诊断或治疗分子标志物。
文献关键词:
胆管肿瘤;癌症基因组图谱;长链非编码RNA GIHCG;标志物
中图分类号:
作者姓名:
付志豪;王亚东;陈家兴;邓东锋;张秀磊;张晓凡;张晓
作者机构:
郑州大学人民医院(河南省人民医院)肝胆胰腺外科,郑州450003;郑州大学第一附属医院急诊监护室,郑州450003
文献出处:
引用格式:
[1]付志豪;王亚东;陈家兴;邓东锋;张秀磊;张晓凡;张晓-.长链非编码RNA GIHCG在胆管癌组织中表达及其临床意义)[J].中华医学杂志,2022(08):569-575
A类:
GIHCG
B类:
长链非编码,癌组织,组织中表达,癌症基因组图谱,TCGA,关长,limma,包分析,癌旁组织,survival,差异基因表达,实时荧光定量聚合酶链反应,real,免疫荧光原位杂交,荧光原位杂交技术,FISH,小干扰,敲低,Transwell,胆管癌细胞,细胞系,迁移能力,差异表达,lncRNAs,生存分析,受试者工作特征,坐标轴,围成,胆管癌患者,淋巴结转移,肿瘤大小,分子标志物,胆管肿瘤
AB值:
0.216977
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