典型文献
单细胞水平微流体技术筛选北极沉积物中的联苯降解菌
文献摘要:
极地环境微生物具有独特而丰富的多样性,是亟待开发的资源宝库.随着人类影响范围的扩大,极地环境中持久性有机污染物与石油资源开采等造成的环境污染不容忽视,而利用土著微生物进行生物修复是一种理想的方法.为克服传统的基于富集驯化的稀释平板法分离降解菌存在耗时长、筛选结果单一等缺点,建立了一种单细胞水平微流体筛选(Single-cell Level Isolation with Microfluidics,SLIM)技术.以北极沉积物为菌源,以联苯为底物,利用该技术成功筛选得到9株菌株,分属于4个菌属:Streptomyces、Micrococcus、Dermacoccus和Aspergillus;通过稀释平板法筛选得到3株菌株,分属于Acidovorax、Chryseobacterium和Nocardia.通过两种方法得到的菌株完全不同.系统发育分析表明,SLIM技术筛选得到的菌株具有更加丰富的微生物多样性.通过对沉积物及各代富集驯化培养物的16SrRNA基因高通量测序发现,并非所有富集的菌属都能被稀释平板法分离,通过SLIM技术筛选得到的菌属在所有样品中的相对丰度都很低.本文建立的SLIM技术从单细胞水平实现了目标菌种的筛选,相比于稀释平板法,具有效率更高的优点,同时避免了菌种间竞争等造成的分离困难.本研究为极地环境中有机污染的生物修复及"微生物暗物质"资源的挖掘提供了新的思路与方法.
文献关键词:
单细胞水平微流体筛选(SLIM);极地区域;有限稀释;有机污染物;石油污染;生物修复;微生物暗物质
中图分类号:
作者姓名:
徐丰俊;刘泽钒;彭睿琪;张逸岚;沈超峰
作者机构:
浙江大学环境与资源学院,杭州310058;浙江省水体污染控制与环境安全技术重点实验室,杭州310058
文献出处:
引用格式:
[1]徐丰俊;刘泽钒;彭睿琪;张逸岚;沈超峰-.单细胞水平微流体技术筛选北极沉积物中的联苯降解菌)[J].环境科学学报,2022(09):1-8
A类:
Dermacoccus,微生物暗物质
B类:
单细胞,微流体,技术筛选,北极,沉积物,联苯,苯降解,降解菌,极地环境,环境微生物,宝库,人类影响,影响范围,持久性有机污染物,石油资源,资源开采,利用土,土著,生物修复,Single,cell,Level,Isolation,Microfluidics,SLIM,菌源,底物,选得,分属,Streptomyces,Micrococcus,Aspergillus,Acidovorax,Chryseobacterium,Nocardia,系统发育分析,微生物多样性,驯化培养,16SrRNA,有样,相对丰度,平实,目标菌,菌种,种间竞争,思路与方法,极地区域,有限稀释,石油污染
AB值:
0.39425
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