典型文献
创伤性脑损伤大鼠模型中与铁死亡相关的基因探索
文献摘要：
目的 探索创伤性脑损伤(traumatic brain injury,TBI)大鼠模型中铁死亡的发生及与其密切相关的基因.方法 将SD大鼠随机分为Sham组和TBI组,采用普鲁士蓝(Perl′s)染色和透射电镜观察TBI大鼠脑组织发生铁沉积和铁死亡的情况;转录组测序初步鉴定TBI大鼠脑组织差异表达基因(differentially express genes,DEGs),将DEGs与数据集GSE111452比较,选择共有的DEGs,再将共有DEGs与铁死亡数据库比对,最终筛选出与铁死亡密切相关的DEGs;最后,通过荧光定量PCR检测大鼠脑组织样本中DEGs的mRNA相对表达量.结果 Perl′s染色结果显示,TBI大鼠脑组织损伤周围区域铁离子沉积现象较Sham组明显;电镜结果显示,TBI大鼠脑组织中神经元形态改变,线粒体萎缩变小,基质颜色变深,膜增厚致密度高,部分外膜模糊并破损,伴有内嵴扩张、减少.测序和信息学分析结果显示,与Sham组比较,TBI大鼠脑组织共有2786个DEGs,与GSE111452数据集交集后发现241个共有DEGs,再与铁死亡相关基因库比对,发现4个与铁死亡相关的DEGs(Slc7a5、Rb1、Fancd2和Pebp1);PCR检测结果显示,TBI大鼠脑组织中Slc7a5和Fancd2基因的mRNA表达水平显著升高,Rb1基因的mRNA表达水平也有升高趋势,但与Sham组比较差异无统计学意义(P>0.05),Pebp1基因的mRNA表达水平显著下降(P<0.05).结论 TBI大鼠脑组织发生了铁死亡,可能与Slc7a5、Rb1、Fancd2和Pebp1基因在TBI大鼠脑组织的差异表达有关.
文献关键词：
创伤性脑损伤(TBI);铁死亡(Ferroptosis);转录组测序;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
杨莉;李坪;吴海鹰;杨方林;杨怡然;揭娟;钱传云
作者机构：
650500 云南 昆明,昆明医科大学第一附属医院急诊医学科;650000 云南 昆明,昆明医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系;650500 云南 昆明,昆明市延安医院重症医学科
文献出处：
引用格式：
[1]杨莉;李坪;吴海鹰;杨方林;杨怡然;揭娟;钱传云-.创伤性脑损伤大鼠模型中与铁死亡相关的基因探索)[J].中国急救医学,2022(02):154-158
A类：
GSE111452,Slc7a5,Fancd2,Pebp1
B类：
创伤性脑损伤,大鼠模型,traumatic,brain,injury,TBI,中铁,Sham,普鲁士蓝,Perl,透射电镜,电镜观察,大鼠脑组织,生铁,铁沉积,转录组测序,组织差异表达,差异表达基因,differentially,express,genes,DEGs,死亡数据,库比,相对表达量,染色结果,脑组织损伤,铁离子,形态改变,色变,变深,增厚,致密度,密度高,分外,外膜,交集,铁死亡相关基因,基因库,Rb1,Ferroptosis,生物信息学分析
AB值：
0.234554
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