典型文献
汉族与藏族健康人群肠道菌群结构的差异
文献摘要：
目的 探究汉族和藏族健康人群肠道菌群差异,为种族?微生物群假说以及以菌群为研究对象的疾病机制研究提供参考.方法 采集同一地区汉族和藏族健康志愿者粪便样本共133例,通过倾向性评分匹配法(propensity score matching,PSM)筛选出42例样本,其中,汉族样本14例,藏族样本28例.通过对样本DNA的16S rRNA基因V3+V4区高通量测序后,生成OTU表并注释.在分析Alpha、Beta多样性基础上,使用R语言的DESeq2包和edgeR包进行汉族和藏族的肠道菌群差异分析;通过bnlearn包、psych包和reshape2包进行网络分析,筛选与民族因素密切相关的菌群,通过LEfSe分析鉴定物种在属水平上的民族生物标志物.最后通过IDBA?UD软件将高质量数据进行拼接组装,使用CD?HIT软件构建非冗余基因集,使用PICRUST分析,获得代谢通路信息和GO注释结果.利用STAMP软件进行组间差异分析,比较两组代谢通路的差异.结果 汉族和藏族肠道菌群共有199个差异OTU,证明汉族和藏族人群的肠道菌群存在差异.藏族肠道菌群中瘤胃球菌属(Ruminococcus)、厌氧支原体属(Anaeroplasma)、变形杆菌属(Proteobacteria)显著高于汉族;丁酸蓖麻单胞菌(Butyricimonas)、粪厌氧棒杆菌(Anaerostipes)、小杆菌属(Dialister)显著低于汉族.与民族因素密切相关的菌群有普氏菌(copri)、粪普雷沃氏菌(stercorea)、副流感嗜血杆菌(Haemophilus parainfluenzae)等.藏族在属水平上菌群标志物为假丁酸弧菌(Pseudobutyrivibrio)、琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)、伯吉古菌(Catenibaterium);汉族属水平上的生物标志物为小杆菌属(Dialister)、血尿杆菌(Turicibacter).差异代谢通路共有10个,在藏族组中显著上调的通路有酶家族、复制和修复、转化、核苷酸代谢、萜类化合物和聚酮类化合物的代谢.结论 本研究部分验证了种族?微生物群假说,菌群与疾病的相关研究应考虑民族因素的影响.
文献关键词：
汉族;藏族;肠道菌群;16S rRNA
中图分类号：
作者姓名：
毛明慧;牛玥;陈春;李树春
作者机构：
中央民族大学药学院,民族医药教育部重点实验室,北京100081;海西州天峻县织合玛乡卫生院,青海天峻817200
文献出处：
引用格式：
[1]毛明慧;牛玥;陈春;李树春-.汉族与藏族健康人群肠道菌群结构的差异)[J].实用医学杂志,2022(03):281-287
A类：
bnlearn,psych,reshape2,IDBA,stercorea,parainfluenzae,Catenibaterium
B类：
健康人群,肠道菌群结构,菌群差异,种族,微生物群,假说,健康志愿者,粪便样本,倾向性评分匹配法,propensity,score,matching,PSM,16S,rRNA,V3+V4,OTU,Alpha,Beta,DESeq2,edgeR,民族因素,LEfSe,分析鉴定,生物标志物,UD,质量数据,拼接,CD,HIT,软件构建,非冗余,冗余基因,PICRUST,STAMP,藏族人群,瘤胃,Ruminococcus,厌氧,支原体,Anaeroplasma,变形杆菌,杆菌属,Proteobacteria,于汉族,丁酸,蓖麻,单胞菌,Butyricimonas,Anaerostipes,Dialister,普氏,copri,普雷沃氏菌,副流感,流感嗜血杆菌,Haemophilus,弧菌,Pseudobutyrivibrio,琥珀酸,Succinivibrio,古菌,族属,血尿,Turicibacter,差异代谢通路,核苷酸代谢,萜类化合物,聚酮类化合物,研究部
AB值：
0.395627
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