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典型文献
甲状腺乳头状癌转移相关基因分类器预后模型的建立与验证
文献摘要:
目的:甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)的发病率居高不下,本研究着眼于建立新型的转移相关基因分类器及相关的预后模型,以有效预测PTC的无进展生存期(progression free interval, PFI),并识别复发高危风险的患者。方法:利用转移相关基因(metastasis-related genes, MTGs)与人类癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)合并分析,并使用套索回归分析及受试者曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)分析来建立相应的新型基因分类器,并与相关的临床特征一起建立预后模型,以预测PTC术后的PFI。最后,在外部数据集和不同细胞系上验证基因分类器的有效性。本研究使用R 3.6.3和GraphPad Prism 8软件进行统计学分析。结果:通过差异整合分析提取了155预后相关的MTGs,从中建立并优化了新型的10基因分类器,预后分析证实分类器评分是PTC的重要独立预后因素。最后,建立了包括新型分类器的回归模型。新型分类器的曲线下面积(area under curve, AUC)为0.76,回归模型的AUC为0.80,同PTC的各种进展期临床特征高度符合,此外,新型分类器与关键临床特征和细胞系的侵袭性密切相关。结论:基于转移相关基因建立的新型分类器和回归模型与PTC的预后密切相关,将有助于临床实践中对PTC患者预后进行精准的个体化预测。
文献关键词:
甲状腺癌;甲状腺乳头状癌;计算生物学;转移相关基因;分类器
作者姓名:
刘睿;曹桢;李晓斌;廖泉;刘子文
作者机构:
中国医学科学院北京协和医院基本外科,北京 100730
引用格式:
[1]刘睿;曹桢;李晓斌;廖泉;刘子文-.甲状腺乳头状癌转移相关基因分类器预后模型的建立与验证)[J].中华内分泌外科杂志,2022(03):293-298
A类:
MTGs
B类:
甲状腺乳头状癌,转移相关基因,基因分类,分类器,预后模型,建立与验证,papillary,thyroid,carcinoma,PTC,居高不下,无进展生存期,progression,free,interval,PFI,高危风险,metastasis,related,genes,类癌,癌症基因图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,套索回归,receiver,operating,characteristic,curve,建立相应,外部数据,细胞系,系上,GraphPad,Prism,统计学分析,差异整合,整合分析,预后分析,独立预后因素,area,under,进展期,特征高度,侵袭性,基于转移,个体化预测,甲状腺癌,计算生物学
AB值:
0.347546
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