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家蚕品种桂蚕8号亲本全基因组重测序研究初报
文献摘要：
对桂蚕8号4个杂交亲本"锦"(9MN)"绣"(芙H)"壮"(7MH)"丽"(87H)开展全基因组重测序研究,通过比对并作初步分析,获得4个全基因组单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、结构性变异(SV)和拷贝数变异(CNV),4个杂交亲本SNP总数均超过600万个位点,插入缺失(Indel)总数约140万;在结构性变异(SV)方面,插入(INS)、缺失(DEL)、倒位(INV)、染色体内易位(ITX)和染色体间易位(CTX)类型均有存在,主要分布在基因间区、内含子、外显子、基因上游、基因下游,在可变剪切位点、UTR5、UTR3及位于一个基因的上游同时也是另一个基因的下游区间亦有分布;拷贝数偏低的区域均超200个,偏高的区域在79～100个之间,所有品种在基因上游、外显子、UTR5、基因间区均有拷贝数变异,其中以外显子区域最多,在可变剪切位点、基因下游、上游/下游、UTR3区域未见有拷贝数变异.
文献关键词：
桂蚕8号;全基因组;重测序
中图分类号：
作者姓名：
黄文功;浦月霞;刘艳伟;苏红梅;韦博尤;安春梅;谭福洋;王平阳;闭立辉
作者机构：
文献出处：
引用格式：
[1]黄文功;浦月霞;刘艳伟;苏红梅;韦博尤;安春梅;谭福洋;王平阳;闭立辉-.家蚕品种桂蚕8号亲本全基因组重测序研究初报)[J].广西蚕业,2022(04):18-24
A类：
9MN,7MH,UTR5,UTR3
B类：
家蚕品种,全基因组重测序,初报,杂交亲本,87H,初步分析,全基因组单核苷酸多态性,SNP,插入缺失,InDel,SV,拷贝数变异,CNV,万个,个位,Indel,INS,DEL,倒位,INV,易位,ITX,CTX,内含子,外显子,可变剪切,子区域
AB值：
0.293551
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