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典型文献
子宫内膜异位症在位内膜中自噬相关基因及ceRNA网络的作用
文献摘要:
目的 通过筛选子宫内膜异位症在位内膜中的自噬相关基因,明晰竞争性内源性RNA(ceRNA)网络在子宫内膜异位症中的作用.方法 从GEO数据库和Human Autophagy Database数据库分别获取子宫内膜异位症数据集和自噬相关基因列表,查找自噬相关基因,通过预测和相关性筛选miRNA和LncRNA并构建ceRNA网络.验证筛选得到的关键基因在其他子宫内膜异位症在位内膜数据集的表达及诊断效能.结果 子宫内膜异位症在位内膜中有39个自噬相关基因存在表达差异,通过PPI查找到7个关键基因,功能富集在巨自噬、线粒体自噬和激活转录因子等,信号通路主要涉及E2F、FOXO、DNA损伤修复、FAS信号通路、PI3K/Akt/mTOR等.构建11个ceRNA调控网络,包括4个mRNA(CASP3、HIF1A、CDKN1A、RPS6KB1)、7 个 miRNA(hsa-let-7e-5p、hsa-miR-124-3p、hsa-miR-199a-5p、hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-24-3p、hsa-miR-30a-5p和hsa-miR-382-5p)和 8 个 LncRNA(NORAD、TUG1、MALAT1、CYTOR、PVT1、EBLN3P、LINC02381和XIST).结论 自噬相关基因参与的ceRNA网络调控关系,可以为我们研究子宫内膜异位症诊断和治疗靶点提供新的方向.
文献关键词:
子宫内膜异位症;ceRNA网络;自噬
作者姓名:
王贞娜;姜雯雯;王真红;张华乐
作者机构:
福建省妇幼保健院福建医科大学妇儿临床医学院 福州350001
文献出处:
引用格式:
[1]王贞娜;姜雯雯;王真红;张华乐-.子宫内膜异位症在位内膜中自噬相关基因及ceRNA网络的作用)[J].福建医药杂志,2022(06):20-25
A类:
EBLN3P,LINC02381
B类:
子宫内膜异位症,在位,自噬相关基因,ceRNA,过筛,竞争性,内源性,GEO,Human,Autophagy,Database,列表,miRNA,LncRNA,选得,关键基因,诊断效能,表达差异,PPI,功能富集,巨自噬,线粒体自噬,E2F,FOXO,损伤修复,FAS,PI3K,Akt,mTOR,调控网络,CASP3,HIF1A,CDKN1A,RPS6KB1,hsa,let,7e,5p,3p,199a,200c,30a,NORAD,TUG1,MALAT1,CYTOR,PVT1,XIST,诊断和治疗,治疗靶点
AB值:
0.322454
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