首站-论文投稿智能助手
典型文献
基于生物信息学和分子对接分析栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的作用机制
文献摘要:
目的 基于生物信息学和分子对接,探讨栀子柏皮汤治疗炎症性肠病(Inflammatory bowel disease,IBD)的主要活性成分及作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)和本草组鉴(HERB)数据库筛选"栀子""甘草""黄柏"三味药材的有效成分和作用靶点,构建"中药-成分-靶点"网络图.通过基因表达数据库(GEO)和DisGeNET数据库筛选炎症性肠病的相关基因,并用R软件进行数据分析和可视化.通过String平台构建药物和疾病交集靶点的蛋白互作网络(PPI),并利用Cytoscape的MCODE插件筛选核心靶点.使用DAVID平台对核心靶点进行GO和KEGG富集分析.使用AutoDock将核心靶点与活性成分进行分子对接.结果 栀子柏皮汤与炎症性肠病共同作用的目标靶点有13个,GO富集分析得到相关条目49个,KEGG通路富集得到35条信号通路.结论 初步探究了栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的潜在靶点和相关通路,栀子柏皮汤中的槲皮素、小檗碱等活性成分,可能通过作用于STAT3、IL-1β和TNF等靶点,调控以TNF、Jak-STAT及NF-κB为代表的信号通路治疗炎症性肠病.
文献关键词:
栀子柏皮汤;炎症性肠病;生物信息;网络药理学;分子对接
作者姓名:
甘晓若;贾金宇;师晨松;佟苗苗;黄芸;吕品;戚欢阳
作者机构:
河北医科大学药学院,河北石家庄050017;河北中医学院实验中心,河北石家庄050000;河北医科大学心血管医学研究中心,细胞生物学教研室,河北石家庄050017;厦门市健康医疗大数据中心(厦门市医药研究所) ,福建厦门361100
文献出处:
引用格式:
[1]甘晓若;贾金宇;师晨松;佟苗苗;黄芸;吕品;戚欢阳-.基于生物信息学和分子对接分析栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的作用机制)[J].海峡药学,2022(11):11-17
A类:
B类:
分子对接,栀子柏皮汤,炎症性肠病,Inflammatory,bowel,disease,IBD,主要活性成分,系统药理学,药理学分析,分析平台,Traditional,Chinese,Medicine,Database,Analysis,Platform,TCMSP,本草,HERB,甘草,黄柏,三味,有效成分,作用靶点,网络图,基因表达数据库,GEO,DisGeNET,String,平台构建,交集靶点,蛋白互作网络,PPI,Cytoscape,MCODE,插件,核心靶点,DAVID,富集分析,AutoDock,标靶点,条目,通路富集,潜在靶点,相关通路,槲皮素,小檗碱,STAT3,Jak,网络药理学
AB值:
0.381282
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。