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典型文献
长非编码反义RNA FMR1-AS1及其正义RNA FMR1在宫颈癌中的表达
文献摘要:
目的:通过整合计算多中心样本研究长非编码反义RNA FMRP翻译调节因子1反义RNA 1(FMRP translational regulator 1 antisense RNA 1,FMR1-AS1)与相应正义RNA FMR1在宫颈癌中的表达.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库检索并下载宫颈癌相关高通量数据集.箱图和独立样本t检验用于比较宫颈癌组织与非癌宫颈组织中FMR1-AS1、FMR1的表达差异.整合计算标准化均数差(standard mean difference,SMD)用于综合探究FMR1-AS1、FMR1在宫颈癌中的表达水平.使用Pearson相关分析研究FMR1-AS1与FMR1表达的相关性.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)用于研究相关的信号通路.结果:合并SMD的结果显示FMR1-AS1在宫颈癌组织中高表达(SMD=0.63,95%CI:0.15~1.11).同时,合并1018例样本(678例宫颈癌组织,340例正常宫颈组织)的结果表明FMR1在宫颈癌组织中的表达显著高于正常宫颈组织(SMD=0.49,95%CI:0.32~0.67).Pearson相关分析表明:FMR1-AS1与FMR1在宫颈癌组织中的表达呈显著正相关(Pearson's r=0.4463,P<0.00001).GSEA结果表明FMR1-AS1和FMR1可能参与基因表达调控相关通路.结论:FMR1-AS1与FMR1在宫颈癌组织中的表达显著上调且两者呈正相关,两者可能共同发挥促癌作用,值得进一步研究二者潜在的调控机制.
文献关键词:
FMR1-AS1;反义RNA;长非编码RNA;FMR1;宫颈癌
作者姓名:
黄秋霞;欧海玲;黄克强;刘姗姗
作者机构:
广西中医药大学第一附属医院病理科,南宁 530023
文献出处:
引用格式:
[1]黄秋霞;欧海玲;黄克强;刘姗姗-.长非编码反义RNA FMR1-AS1及其正义RNA FMR1在宫颈癌中的表达)[J].临床与病理杂志,2022(09):2074-2083
A类:
FMRP
B类:
长非编码,反义,FMR1,AS1,多中心,调节因子,translational,regulator,antisense,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,Gene,Expression,Omnibus,GEO,数据库检索,下载,高通量数据,宫颈癌组织,表达差异,计算标准,均数,standard,mean,difference,SMD,综合探究,基因集富集分析,gene,set,enrichment,analysis,GSEA,正常宫颈组织,基因表达调控,相关通路,促癌作用,调控机制
AB值:
0.25837
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