典型文献
基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性
文献摘要:
为探索16 S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16 S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mamma-lia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Ac-tinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析.结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有较高相似度,可以鉴定到种的水平.测序所得的基因序列与参考序列的种内遗传距离为0~0.5%、种间遗传距离为1.0%~39.9%,最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,即存在明显的条形码间隔;另外5个样本(5个物种)测序结果在属内种间高度一致,只能鉴定到属的水平.基于16S rRNA基因片段构建的条形码可对濒危脊椎动物进行种属鉴定,可为濒危物种保护、打击非法走私等提供技术支撑.
文献关键词:
濒危脊椎动物;16S rRNA;种属鉴定
中图分类号:
作者姓名:
蒋晓霞;徐博文;李伟刚;邵建宏;周傲白雪;唐泰山;赵福振;苗丽;黄海超;罗宝正
作者机构:
拱北海关技术中心,珠海,519001;南京海关动植物与食品检测中心,南京,210019;郑州海关技术中心,郑州,450003
文献出处:
引用格式:
[1]蒋晓霞;徐博文;李伟刚;邵建宏;周傲白雪;唐泰山;赵福振;苗丽;黄海超;罗宝正-.基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性)[J].野生动物学报,2022(01):51-57
A类:
濒危脊椎动物,Mamma,Chondrichthyes,tinopterygii
B类:
16S,rRNA,条形码技术,物物,物种鉴定,bp,通用引物,哺乳纲,爬行纲,Reptilia,两栖纲,Amphibia,软骨鱼,Ac,动物样本,扩增产物,基因序列分析,样本扩增,GenBank,参考序列,种内,遗传距离,种间,小种,大种,高度一致,种属鉴定,濒危物种保护,走私
AB值:
0.284806
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