典型文献
不同居群红砂的遗传多样性分析
文献摘要:
为了探究不同居群红砂(Reaumuria soogorica)的遗传多样性水平及居群遗传结构.本研究运用SSR分子标记技术对来源于内蒙古、宁夏、甘肃16个不同居群的299份红砂材料进行遗传多样性分析.结果表明11对引物共扩增出67个等位基因,扩增等位基因多态率为83.58%,多态信息含量(Polymorphism information content,PIC)为0.396;居群的等位基因数(Allele number,Na)和有效等位基因数(Effective number of alleles,Ne)为3.735,2.221;香农信息指数(Shannon information index,I)为0.763;居群间遗传分化系数(Fixation index,Fst)为0.041~0.210,平均值为0.088.AMOVA结果表明,居群间的遗传差异仅占变异总来源的5.8%.本研究得出结论红砂的基因多态性为中度,等位基因不均匀的分布在染色体上.观测杂合度和固定指数说明居群内杂合度缺失,纯合体过量.Fst指数表明居群间分化程度较低,且红砂的遗传变异主要来自源于个体内DNA序列的不同.Mantel检测得出遗传距离和地理距离显著相关.聚类分析表明居群间的基因交流是影响居群聚类的重要因素.STRUCTURE结构分析将材料分为5个亚群,第Ⅴ亚群内红砂个体血统较为纯正,第Ⅱ亚群内个体血统混杂.
文献关键词:
红砂;SSR;遗传多样性;遗传结构;聚类分析
中图分类号:
作者姓名:
张旭;苏世平;师微柠;Alizet Didi Dom;马强
作者机构:
甘肃农业大学,甘肃兰州730070
文献出处:
引用格式:
[1]张旭;苏世平;师微柠;Alizet Didi Dom;马强-.不同居群红砂的遗传多样性分析)[J].草地学报,2022(09):2336-2344
A类:
soogorica
B类:
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AB值:
0.353935
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