典型文献
一种流形正则化非负矩阵分解的IncRNA-疾病关系预测方法
文献摘要：
长链非编码RNA(lncRNA)在疾病的发生中起着重要作用,然而通过生物学实验探索lncRNA与疾病的关系昂贵且费时,必须开发出更准确和有效的计算方法来预测lncRNA与疾病的关系.本文提出了 一种新的基于流形正则化非负矩阵分解的计算方法(MRNMFLDA)来预测lncRNA与疾病的关系.该方法首先采用相似性网络融合方法分别整合lncRNA与疾病的相似性,然后通过构建标签加权矩阵、引入流形正则化约束的非负矩阵分解算法来预测lncRNA与疾病潜在的关系.实验结果表明,本方法在留一交叉验证和5折交叉验证中AUC值分别达到0.8927和0.8635±0.0054,优于其他4种方法.案例研究表明,本方法能够有效地预测与3种疾病(肺癌,宫颈癌,和骨肉瘤)有关系的lncRNA.
文献关键词：
lncRNA-疾病关系预测;非负矩阵分解;相似性网络融合;标签加权矩阵;流形正则化
中图分类号：
作者姓名：
董文文;林志毅
作者机构：
广东工业大学计算机学院,广州510006
文献出处：
引用格式：
[1]董文文;林志毅-.一种流形正则化非负矩阵分解的IncRNA-疾病关系预测方法)[J].小型微型计算机系统,2022(08):1589-1595
A类：
MRNMFLDA,相似性网络融合,标签加权矩阵
B类：
流形正则化,非负矩阵分解,IncRNA,疾病关系,长链非编码,lncRNA,生物学实验,实验探索,昂贵,费时,融合方法,入流,正则化约束,留一交叉验证,宫颈癌,骨肉瘤
AB值：
0.166682
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