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分子对接结合荧光光谱法探究杨梅苷与胰蛋白酶相互作用机理
文献摘要：
运用荧光猝灭法及分子对接模拟,对杨梅苷(myricitrin,MYT)和胰蛋白酶(trypsin,Tryp)之间的相互作用情况进行了研究.通过荧光光谱实验可以得出,在pH=8.4的条件下,在温度为17,27和37℃时,MYT可以有效地猝灭Tryp的荧光发射.通过Stern-Volmer以及双对数方程计算可知,MYT猝灭Tryp的荧光发射机制为静态猝灭,即主客体间形成稳定的复合物.在37℃时,Tryp与MYT的表观结合常数KA为3.2×104 L·mol-1,结合位点数n为1.44.使用Van't Hoff方程计算得到主客体结合的热力学常数为ΔH＞0,ΔS＞0,ΔG＜0,可知疏水作用和氢键对形成Tryp∶MYT复合物具有显著的促进作用.此外,利用同步荧光光谱法研究了Tryp与MYT的结合位置,结果表明,MYT与Tryp的结合对TyrPhe,His及Trp残基的影响基本相同.分子对接结果表明,MYT结合在Tryp表面,主客体之间存在多个疏水及氢键作用.分子动力学模拟表明,Tryp∶MYT复合物的动力学性质稳定,在30 ns时间内结构变化很小,主客体的均方根差(root mean square deviation,RMSD)平均值分别为 1.672与1 255 ?.
文献关键词：
胰蛋白酶;杨梅苷;荧光光谱法;分子对接;相互作用
中图分类号：
作者姓名：
于湛;孙璐;谷笑雨;刘珂帆;刘丽艳;王晓丹
作者机构：
沈阳师范大学 化学化工学院,沈阳 110034;北京师范大学 化学学院,北京 100875;朝阳市第一中学,辽宁 朝阳 122000
文献出处：
引用格式：
[1]于湛;孙璐;谷笑雨;刘珂帆;刘丽艳;王晓丹-.分子对接结合荧光光谱法探究杨梅苷与胰蛋白酶相互作用机理)[J].沈阳师范大学学报（自然科学版）,2022(03):264-269
A类：
myricitrin,MYT,TyrPhe
B类：
荧光光谱法,杨梅苷,胰蛋白酶,荧光猝灭法,分子对接模拟,trypsin,Tryp,光谱实验,荧光发射,Stern,Volmer,对数方程,光发射机,主客体,复合物,结合常数,KA,结合位点,Van,Hoff,疏水作用,同步荧光光谱,His,Trp,残基,基本相同,氢键作用,分子动力学模拟,动力学性质,ns,均方根差,root,mean,square,deviation,RMSD
AB值：
0.29632
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