典型文献
加权基因共表达网络分析慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制
文献摘要：
目的:挖掘慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病的相关基因,探讨其可能机制.方法:采用加权基因共表达网络算法对健康个体及慢性鼻窦炎患者的钩突及息肉组织的基因表达芯片GSE36830进行分析,筛选出与慢性鼻窦炎伴鼻息肉显著相关的模块,并进一步筛选出核心基因,对核心基因进行GO及KEGG分析.最后对核心基因表达量进行差异分析进一步缩小核心基因的范围.结果:在GSE36830芯片中,加权基因共表达网络算法计算出与慢性鼻窦炎伴鼻息肉显著相关的模块为棕色模块,其中包含392个基因,将棕色模块中的基因按模块身份与基因显著性的不同阈值进一步筛选核心基因,共24个基因为核心基因.对24个核心基因进行GO及KEGG分析后可发现相关基因与细胞免疫关系密切,主要作用于细胞膜,通过调节细胞因子、趋化因子的活性及相关受体等发挥生物学功能.进一步对核心基因表达量进行差异分析,基因CCL22、GFI1B、ITGAM、FCER2、CLEC4GP1、CD1E、ALPK2、VSTM1、AOC1、MGARP、IL2RA、COL6A5、CD1A、CLC、SIGLEC8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉组息肉组织中与其他组的钩突组织间存在显著差异.结论:加权基因共表达网络可以挖掘出在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中可能存在重要生物学意义的新基因.
文献关键词：
慢性鼻窦炎伴鼻息肉;加权基因共表达网络;GO分析;KEGG分析;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
陈哲;肖伟;刘萌芷;彭涛;叶林峰
作者机构：
武汉大学中南医院耳鼻咽喉-头颈外科 湖北 武汉 430071
文献出处：
引用格式：
[1]陈哲;肖伟;刘萌芷;彭涛;叶林峰-.加权基因共表达网络分析慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制)[J].武汉大学学报（医学版）,2022(05):811-816
A类：
GSE36830,CLEC4GP1,CD1E,ALPK2,VSTM1,AOC1,MGARP,IL2RA,COL6A5,CD1A,SIGLEC8
B类：
加权基因共表达网络分析,慢性鼻窦炎伴鼻息肉,可能机制,网络算法,健康个体,核心基因,基因表达量,算法计算,棕色,细胞免疫,细胞膜,趋化因子,生物学功能,CCL22,GFI1B,ITGAM,FCER2,CLC,挖掘出,生物学意义,新基因,差异表达基因
AB值：
0.126873
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