典型文献
基于协方差估计的多因变量回归模型的多性状QTL定位研究
文献摘要:
[目的]基于协方差估计的多因变量回归(multivariate regression with covariance estimation,MRCE)模型进行多性状QTL定位分析,为动植物数量性状基因定位提供理论参考.[方法]构建适用QTL定位的MRCE模型,设计3个模拟试验对模型进行检验,通过计算机生成基因型和2个相关性状的表型值,并用2组数据对模型进行实际应用,其中一组为水稻DH群体数据,选自qtlnetwork软件;另一组为水稻永久F2群体数据,由珍汕97×明恢63,含有210个株系的重组自交系(RIL)群体随机交配生成,分析MRCE模型在以上2组数据多性状QTL定位中的应用效果.[结果]用MRCE模型进行QTL定位的模拟试验结果表明,遗传变异所占方差比越大,相关系数绝对值越大,遗传率越大,则功效越好,估计值越接近效应值.MRCE的QTL定位应用结果显示,从水稻DH群体中识别出8个QTL与ph6性状有关,6个QTL与ph8性状有关;从1998年水稻永久F2群体数据中识别出3个QTL与穗粒数相关,10个QTL与粒质量相关;从1999年数据识别出3个QTL与穗粒数相关,6个QTL与粒质量相关.[结论]利用MRCE模型进行多性状QTL定位是可行的.
文献关键词:
数量性状;QTL定位;多因变量;协方差估计;回归模型
中图分类号:
作者姓名:
张慧;叶景山;申佳瑜;刘慧铭;尹宁;李立婷;温永仙
作者机构:
福建农林大学计算机与信息学院,福建福州,350002;福建农林大学统计及应用研究所,福建福州,350002;漳州农业发展集团有限公司,福建漳州,363000;厦门华厦学院,福建厦门361021
文献出处:
引用格式:
[1]张慧;叶景山;申佳瑜;刘慧铭;尹宁;李立婷;温永仙-.基于协方差估计的多因变量回归模型的多性状QTL定位研究)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2022(09):135-143
A类:
多因变量,MRCE,qtlnetwork,接近效应,ph6,ph8
B类:
协方差估计,变量回归,多性状,QTL,定位研究,multivariate,regression,covariance,estimation,定位分析,动植物,数量性状,基因定位,模拟试验,基因型,相关性状,水稻,DH,选自,另一组,F2,株系,重组自交系,RIL,交配,遗传变异,估计值,定位应用,穗粒数,粒质量,质量相关,年数,数据识别
AB值:
0.261847
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