典型文献
角倍蚜与盐肤木转录组比较及潜在的水平基因转移
文献摘要:
本研究采用高通量测序技术Illumina平台测定角倍蚜与其唯一第一寄主植物盐肤木转录组序列,共获得角倍蚜Unigenes 25 077条,盐肤木Unigenes 40 003条,与NR、GO和KEGG等数据库进行比对注释角倍蚜和盐肤木转录组基因信息.结果显示,角倍蚜和盐肤木功能注释基因均包括3大类,分别有51和49个功能亚类,其中,细胞组分Unigenes数最多;角倍蚜43个代谢途径分支中Unigenes集中在信号转导通路、翻译过程和内分泌系统,盐肤木20个代谢途径分支中Unigenes集中在翻译过程通路、碳水化合物代谢和内质网蛋白加工通路;角倍蚜和盐肤木转录因子家族均有20个,其中角倍蚜的锌指结构转录因子家族最多,主要参与环境适应、发育、代谢和免疫调节等活动,盐肤木的MYB超家族转录因子家族最多,参与植物的发育和各种胁迫条件适应;比较角倍蚜与盐肤木转录组序列,发现二者之间存在相似性较高的序列,BLAST搜索和同源序列分析认为可能是通过基因转移的方式获得,蚜虫和寄主植物间存在潜在的水平基因转移事件.
文献关键词:
角倍蚜;寄主植物;高通量测序;转录组;水平基因转移
中图分类号:
作者姓名:
刘江;张艳峰;任竹梅
作者机构:
山西大学 生命科学学院,山西 太原030006
文献出处:
引用格式:
[1]刘江;张艳峰;任竹梅-.角倍蚜与盐肤木转录组比较及潜在的水平基因转移)[J].山西大学学报(自然科学版),2022(06):1675-1681
A类:
B类:
角倍蚜,盐肤木,水平基因转移,高通量测序技术,Illumina,寄主植物,植物盐,转录组序列,共获,Unigenes,NR,基因信息,功能注释,注释基因,亚类,数最多,代谢途径,信号转导通路,翻译过程,内分泌系统,碳水化合物代谢,内质网,锌指,环境适应,免疫调节,MYB,超家族,胁迫条件,BLAST,序列分析,蚜虫
AB值:
0.253535
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