典型文献
水稻DUF761基因家族的鉴定及在非生物逆境中的表达分析
文献摘要:
DUF761家族是一类含有未知功能域(domain of unknown function,DUF)的蛋白.在模式植物拟南芥中的研究表明该基因家族参与调控植物的生长发育以及胁迫应答,但是在作物中的研究甚少,其生物学功能也不明确.为揭示DUF761基因家族在水稻应对非生物逆境胁迫中的生物学功能,本研究通过生物信息学的方法,对水稻DUF761家族基因特征、蛋白质亚细胞定位和非生物逆境诱导表达模式等进行了分析.结果表明,水稻DUF761基因家族共7个成员,分布在水稻3、6、7、8、10和12号染色体上,所编码的蛋白质含有1~2个DUF761结构域,进化分析显示该蛋白家族可分为Ⅰ~Ⅲ亚群.启动子顺式作用元件分析表明,所有的OsDUF761成员都含有多种类型的逆境响应相关顺式作用元件.非生物胁迫诱导表达模式分析表明,7个OsDUF761基因均不同程度地受到非生物胁迫诱导差异表达,其中OsDUF761.04受PEG诱导上调表达最为显著,OsDUF761.03受NaCl处理诱导表达量增加最显著,OsDUF761.02受低温胁迫诱导表达量增加最为显著,OsDUF761.04受脱水胁迫诱导上调表达最为显著.
文献关键词:
水稻;DUF761;生物信息学;非生物胁迫;诱导表达模式
中图分类号:
作者姓名:
张应新;盛锋;杜雪竹;胡琴
作者机构:
湖北大学生命科学学院,湖北 武汉430062
文献出处:
引用格式:
[1]张应新;盛锋;杜雪竹;胡琴-.水稻DUF761基因家族的鉴定及在非生物逆境中的表达分析)[J].湖北大学学报(自然科学版),2022(06):750-758
A类:
DUF761,DUF,OsDUF761
B类:
水稻,基因家族,表达分析,功能域,domain,unknown,function,拟南芥,家族参与,胁迫应答,甚少,生物学功能,非生物逆境胁迫,家族基因,基因特征,亚细胞定位,诱导表达模式,结构域,进化分析,白家,亚群,启动子,顺式作用元件,多种类型,逆境响应,非生物胁迫,表达模式分析,差异表达,PEG,NaCl,低温胁迫,脱水胁迫
AB值:
0.219398
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