典型文献
氯离子通道膜蛋白内部离子输运的动力学模拟
文献摘要:
为了方便、直观地研究氯离子通道膜蛋白内部氯离子输运过程的动力学性质,利用全原子分子动力学模拟方法对大肠杆菌氯离子通道膜蛋白的蛋白质-膜-水溶液系统进行能量最小化和平衡模拟,并对氯离子在通道中输运过程的受力进行拉伸分子动力学模拟计算.结果表明:平衡模拟约40 ns后,膜蛋白结构逐步达到热力学平衡态;通道内部中间结合位点氯离子与周围氨基酸相互作用最强,稳定性最好;氯离子输运过程中主要受到通道尺寸影响,通道宽处受力小,通道窄处受力大,其中靠近外部结合位点处通道最窄,氯离子所受拉力最大,约为300 pN.
文献关键词:
氯离子通道膜蛋白;分子动力学模拟;拉伸分子动力学;离子输运
中图分类号:
作者姓名:
于涛;胡雄飞;王哲;向泽雨;王鑫
作者机构:
江汉大学光电材料与技术学院,湖北 武汉430056;江汉大学人工智能学院,湖北 武汉430056;江汉大学医学院,湖北 武汉430056
文献出处:
引用格式:
[1]于涛;胡雄飞;王哲;向泽雨;王鑫-.氯离子通道膜蛋白内部离子输运的动力学模拟)[J].济南大学学报(自然科学版),2022(06):718-722,731
A类:
氯离子通道膜蛋白,拉伸分子动力学
B类:
离子输运,动力学性质,分子动力学模拟,大肠杆菌,水溶液,能量最小化,ns,蛋白结构,热力学平衡,平衡态,结合位点,氨基酸相互作用,外部结合,受拉,拉力,pN
AB值:
0.183816
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