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典型文献
基于TCGA与GTEx数据库分析AEBP1基因在不同分型胶质瘤中的表达及对预后的影响
文献摘要:
目的 探讨AEBP1基因及其剪接异构体在不同分型胶质瘤中的表达,分析AEBP1基因对不同分型胶质瘤患者预后的影响.方法 利用GEPIA2可视化网络分析工具,对TCGA数据库中胶质母细胞瘤(GBM)(经典型、间充质型、神经元型、原神经元型)与低级别胶质瘤(LGG)(星型细胞瘤、少突星型细胞瘤、少突胶质细胞瘤)组织,与TCGA和GTEx数据库中人体正常组织样本采用单因素方差分析法比较AEBP1基因表达水平.绘制小提琴图分析AEBP1基因剪接异构体在胶质瘤中的分布趋势.绘制Kaplan-Meier生存曲线并采用Logrank检验分析GBM与LGG肿瘤组织中AEBP1基因表达水平对胶质瘤患者预后的影响.结果 GBM总体及4种分型GBM的肿瘤组织中AEBP1的表达均高于正常对照组织(P<0.05).LGG中星型细胞瘤与少突星型细胞瘤肿瘤组织中AEBP1的表达高于正常对照组织(P<0.05).GBM与LGG中有9种AEBP1基因剪接异构体表达且GBM中表达水平均较高.GBM患者总体与原神经元型GBM患者的AEBP1低表达组整体生存期(OS)优于高表达组(P<0.05).LGG患者总体与星型胶质细胞瘤患者AEBP1低表达组OS与无进展生存期均优于高表达组(P<0.05).结论 AEBP1在GBM与LGG的发病与发展中具有重要临床价值,可作为评估原神经元型GBM与星型胶质细胞瘤患者预后的标志物,并可能成为靶向治疗的候选基因.
文献关键词:
胶质母细胞瘤;低级别胶质瘤;AEBP1基因;TCGA数据库;GTEx数据库
作者姓名:
王伟;王茂德;姜海涛;李传坤;答嵘
作者机构:
西安交通大学第一附属医院神经外科,陕西西安 710061;西安交通大学第一附属医院检验科,陕西西安 710061
引用格式:
[1]王伟;王茂德;姜海涛;李传坤;答嵘-.基于TCGA与GTEx数据库分析AEBP1基因在不同分型胶质瘤中的表达及对预后的影响)[J].西安交通大学学报(医学版),2022(04):503-508
A类:
B类:
TCGA,GTEx,数据库分析,AEBP1,不同分型,剪接异构体,GEPIA2,可视化网络,胶质母细胞瘤,GBM,经典型,原神,低级别胶质瘤,LGG,少突胶质细胞,胶质细胞瘤,正常组织,单因素方差分析,方差分析法,基因表达水平,小提琴,Kaplan,Meier,生存曲线,Logrank,检验分析,肿瘤组织,正常对照,中星,低表达,OS,星型胶质细胞,无进展生存期,临床价值,靶向治疗,候选基因
AB值:
0.212598
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