典型文献
植物病原真菌RNA甲基转移酶的筛选与分析
文献摘要:
RNA甲基化是最主要的RNA修饰方式,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰,在生物生长发育过程中发挥重要的调控作用.作为RNA甲基化修饰的重要蛋白,RNA甲基转移酶在植物病原真菌中的功能尚未见报道.本研究利用生物信息学方法,对植物病原真菌RNA甲基转移酶的结构及功能进行了初步探究.结果表明,在106种植物病原真菌中,共鉴定到159个RNA甲基转移酶基因,通过理化性质分析可知,159个植物病原真菌RNA甲基转移酶编码氨基酸的平均长度约为470 aa(变化范围:179~1206 aa),平均相对分子量约为52.64 kD(变化范围:20.04~134.35 kD),平均等电点约为7.26(变化范围:4.90~10.28).植物病原真菌RNA甲基转移酶的进化关系较为保守,相同门的植物病原真菌RNA甲基转移酶大体聚集在同一进化枝,且同一进化枝中蛋白保守基序的相似性较高.利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法对玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)中编码RNA甲基转移酶(S.turcica RNA methyltransferases 1,StMETTL1)的基因在病菌不同发育时期的表达量进行分析发现,StMETTL1在侵染钉时期的表达量显著升高(P<0.05),推测StMETTL1可能在玉米大斑病菌侵染宿主过程中发挥了重要的作用.本研究为进一步了解m6A在植物病原真菌中的作用提供了数据支持.
文献关键词:
植物病原真菌;mRNA甲基化;RNA甲基转移酶;生物信息学分析
中图分类号:
[2]
农业科学(S)
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植物保护(S4)
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病虫害及其防治(S43)
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农作物病虫害及其防治(S435)
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禾谷类作物病虫害(S435.1)
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玉米病虫害(S435.13)
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玉米病害(S435.131)
作者姓名:
贾明轩;周贺;王茂存;孙菡笛;程圳;范永山;巩校东;谷守芹;刘玉卫;董金皋
作者机构:
河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室/华北作物改良与调控国家重点实验室,保定071000;唐山师范学院生命科学系,唐山063002
文献出处:
引用格式:
[1]贾明轩;周贺;王茂存;孙菡笛;程圳;范永山;巩校东;谷守芹;刘玉卫;董金皋-.植物病原真菌RNA甲基转移酶的筛选与分析)[J].农业生物技术学报,2022(09):1810-1822
A类:
StMETTL1
B类:
植物病原真菌,甲基转移酶,N6,腺嘌呤,methyladenosine,m6A,真核生物,后修饰,甲基化修饰,见报,研究利用,利用生物,生物信息学方法,对植,结构及功能,酶基因,性质分析,平均长度,aa,变化范围,平均相对分子量,kD,等电点,进化关系,同门,保守基序,qPCR,玉米大斑病菌,Setosphaeria,turcica,methyltransferases,不同发育时期,侵染,宿主,生物信息学分析
AB值:
0.21711
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