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基于高通量测序技术的胆囊癌患者肠道菌群变化特点
文献摘要：
目的 使用高通量测序技术检测胆囊癌(GBC)患者肠道菌群,探讨其分布及菌群功能特点.方法 收集于2020年9月至2021年9月在郑州大学第一附属医院就诊的14例GBC患者为GBC组,选取9例健康志愿者为健康对照组,两组性别年龄相匹配,提取DNA,使用16S核糖体RNA基因测序技术分析微生物种群,通过PICRUSt2预测菌群功能差异.结果 与健康对照组相比,GBC组粪便样本Proteobacteria丰度增高,Bacteroidetes丰度降低(P<0.001);GBC组Chao1指数、goods_coverage指数、Shannon指数、simpson指数、observed_species指数5项α多样性均降低(P<0.05);β多样性显示,GBC组与健康对照组菌群分区明显,群落结构存在明显差异(P<0.05).线性判别效应分析结果显示,在属水平上,GBC组Roseburia、Prevotella_2、Prevotella_9、Bacteroidaceae丰度高于对照组,而Enterobacteriales、Proteobacteria、Klebsiella、Lactobacillales丰度低于对照组(P<0.05).Escherichia-Shigella可定义为在GBC一定区域范围内能对生长环境产生较大影响的菌属,Parasutterella可作为区分GBC组和健康对照组间差异的关键性物种.京都基因和基因组百科全书(KEGG)结果显示,GBC组与健康对照组间的菌群代谢存在差异.结论 与健康人群相比,GBC患者肠道菌群多样性和结构存在明显不同,表明肠道菌群可能在GBC发生发展过程中起重要作用.
文献关键词：
胆囊癌;肠道菌群;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
陈文辉;于龙;刘文韬;翟文龙
作者机构：
郑州大学第一附属医院 肝胆胰外科,河南 郑州 450052
文献出处：
引用格式：
[1]陈文辉;于龙;刘文韬;翟文龙-.基于高通量测序技术的胆囊癌患者肠道菌群变化特点)[J].河南医学研究,2022(24):4431-4437
A类：
B类：
高通量测序技术,胆囊癌,肠道菌群变化,变化特点,GBC,菌群功能,功能特点,郑州大学,健康志愿者,16S,核糖体,基因测序技术,微生物种群,PICRUSt2,功能差异,粪便样本,Proteobacteria,Bacteroidetes,Chao1,goods,coverage,Shannon,simpson,observed,species,群落结构,线性判别,Roseburia,Prevotella,Bacteroidaceae,Enterobacteriales,Klebsiella,Lactobacillales,Escherichia,Shigella,可定义,区域范围,内能,生长环境,Parasutterella,京都基因和基因组百科全书,健康人群,肠道菌群多样性
AB值：
0.364887
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