典型文献
西安市下呼吸道感染性疾病患者病原菌分布及耐药性分析
文献摘要：
目的 使用宏基因组二代测序(mNGS)分析西安市下呼吸道感染性疾病患者的病原菌分布及耐药性.方法 选取西安市中心医院、西安市第一医院、西安市第三医院、西安市第四医院收治的187例下呼吸道感染性疾病患者,均进行mNGS检测.记录mNGS的诊断结果,分析患者革兰氏阴性(G-)菌、革兰氏阳性(G+)菌的分布情况.以临床最终诊断为金标准,分析mNGS对下呼吸道感染性疾病患者病原菌的诊断价值.使用Kappa检验分析mNGS与临床最终诊断结果的一致性.根据测序结果,记录患者病原菌的耐药基因和可移动遗传元件类型.对下呼吸道感染性疾病患者耐药基因类型与可移动遗传元件检测结果进行聚类分析.结果 187例下呼吸道感染性疾病患者中,156例诊断为病原菌感染,共检出病原菌32种,以鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌为主,其中G-菌23种,G+菌9种.mNGS诊断下呼吸道感染性疾病患者病原菌感染与临床最终诊断具有较好的一致性(Kappa值为0.859).共检出24种耐药基因,以β-内酰胺酶类耐药基因(41.67％)和氨基糖苷类耐药基因(25.00％)为主,其中TEM、KPC、gyrA占比较高.共检出9种可移动遗传元件,其中intⅠ(28.21％)、ISaba1(13.46％)、IS903(12.18％)占比较高.聚类分析结果显示,TEM与intⅠ、ISaba1相关联,KPC、ADC、aac(3)-Ⅰ、OXA-1、armA、OXA-23、aph(3')-Ⅲ与IS903相关联,aac(3)-Ⅰ与IS26相关联.结论 mNGS与临床最终诊断的一致性较高,有助于下呼吸道感染性疾病患者精准医疗的开展,并可通过检测可移动遗传元件,分析其与耐药基因的相关性,明确病原菌的耐药性变迁,进而有助于临床用药方案的优化.
文献关键词：
下呼吸道感染性疾病;病原菌;耐药基因;西安;宏基因组二代测序;聚类分析
中图分类号：
作者姓名：
张惠民;鱼军;白洁;薛刚;李建英
作者机构：
西安市中心医院呼吸与危重症医学科,陕西 西安,710004
文献出处：
引用格式：
[1]张惠民;鱼军;白洁;薛刚;李建英-.西安市下呼吸道感染性疾病患者病原菌分布及耐药性分析)[J].临床医学研究与实践,2022(27):5-10
A类：
ISaba1,IS903
B类：
西安市,下呼吸道感染性疾病,病原菌分布,耐药性分析,宏基因组二代测序,mNGS,中心医院,诊断结果,革兰氏,G+,金标准,诊断价值,Kappa,检验分析,耐药基因,可移动遗传元件,基因类型,元件检测,病原菌感染,共检出,鲍曼不动杆菌,铜绿假单胞菌,金黄色葡萄球菌,内酰胺酶,酶类,氨基糖苷类,TEM,KPC,gyrA,int,相关联,ADC,aac,OXA,armA,aph,IS26,精准医疗,耐药性变迁,临床用药,用药方案,方案的优化
AB值：
0.186797
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