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贵州草海鲫鱼HIF-1α和HIF-2α基因克隆与表达分析
文献摘要：
为研究鲫鱼中HIF不同亚型基因的结构与生物学功能,克隆获得鲫鱼中HIF同源基因的2种亚型,分别命名为Ca-HIF1α和Ca-HIF2α.其中,Ca-HIF1αcDNA全长共3867 bp,开放阅读框2322 bp,编码774个氨基酸.Ca-HIF2αcDNA全长共4647 bp,开放阅读框2460 bp,编码820个氨基酸.预测蛋白质的分子质量分别为85.844、91.228 ku,等电点分别为5.12和6.20.SMART分析结果可知,二者具有HLH、PAS和PAC结构域,此外,多序列比对结果显示二者还具有ODD、N-TAD和C-TAD功能域.进化树结构表明,Ca-HIF2α比Ca-HIF1α进化得要快.实时荧光定量PCR结果显示,Ca-HIF2αmRNA在所检测组织中的相对表达量均高于Ca-HIF1αmRNA的表达量.此外,Ca-HIF1α和Ca-HIF2αmRNA在肝脏和鳃的相对表达量最高.
文献关键词：
鲫鱼;HIF1α基因;HIF2α基因;组织表达;生物学功能
中图分类号：
作者姓名：
李青;葛传龙;欧阳力剑;金志梅;杨钦
作者机构：
贵州省典型高原湿地生态保护与修复重点实验室,贵州毕节551700;贵州工程应用技术学院生态工程学院,贵州毕节551700
文献出处：
引用格式：
[1]李青;葛传龙;欧阳力剑;金志梅;杨钦-.贵州草海鲫鱼HIF-1α和HIF-2α基因克隆与表达分析)[J].江苏农业科学,2022(17):31-38
A类：
B类：
草海,鲫鱼,基因克隆与表达,表达分析,不同亚型,生物学功能,同源基因,HIF1,HIF2,cDNA,全长,bp,开放阅读框,分子质量,ku,等电点,SMART,HLH,PAS,PAC,结构域,多序列比对,ODD,TAD,功能域,进化树,树结构,相对表达量,组织表达
AB值：
0.340597
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