典型文献
石家庄新型冠状病毒肺炎疫情新型冠状病毒分子流行病学特征
文献摘要：
目的:从分子层面分析石家庄新型冠状病毒的流行病学特征，揭示此次传播链的源头，为新型冠状病毒肺炎疫情防控提供科学依据。方法:收集2021年1月2—8日来自石家庄市第五医院170例新型冠状病毒感染者共计404份新型冠状病毒核酸阳性样本，采用多重聚合酶链反应靶向测序技术对样本进行深度测序获得病毒一致性序列。采用PANGOLIN分类系统对170个毒株序列进行分析，采用T-test对数据进行统计学分析。结果:在404份新型冠状病毒核酸阳性样本中，356份获得病毒的全长基因组序列（>95%，100×测序深度），剔除重复取样，得到170株全基因组序列，所有样本均属于B.1.1分支。病毒突变数18~22个，大部分突变不改变氨基酸信息。根据基因组突变个数和种类，所有毒株分为48个亚型，其中2个毒株占主导（分别为66株和31株）。结论:本研究中所有新型冠状病毒肺炎患者来自单一源头的境外输入性病例，病毒在社区隐匿传播了一段时间，并且在传播的过程中发生了变异。
文献关键词：
新型冠状病毒;新型冠状病毒肺炎;多重PCR测序
中图分类号：
作者姓名：
高会霞;杨林;郭云;王逸丛;刘玉珍;唐岳;赫章;梁鑫明;黄顺楷;高鹏;黄颖;戴慕巍;张志;胡倩;王瑜玲;陈芳;戴二黑;江平;杜玉涛
作者机构：
石家庄市第五医院检验科，石家庄050021;中国科学院大学生命科学学院，北京，100049;石家庄医学检验实验室有限公司，石家庄050000;河北医科大学第四医院骨科，石家庄050010;石家庄市第五医院结核科，石家庄050021;石家庄市第五医院内科，石家庄050021
文献出处：
引用格式：
[1]高会霞;杨林;郭云;王逸丛;刘玉珍;唐岳;赫章;梁鑫明;黄顺楷;高鹏;黄颖;戴慕巍;张志;胡倩;王瑜玲;陈芳;戴二黑;江平;杜玉涛-.石家庄新型冠状病毒肺炎疫情新型冠状病毒分子流行病学特征)[J].中华检验医学杂志,2022(06):637-641
A类：
PANGOLIN
B类：
新型冠状病毒肺炎疫情,分子流行病学,流行病学特征,传播链,日来,石家庄市,新型冠状病毒感染者,新型冠状病毒核酸,阳性样本,多重聚合酶链反应,靶向测序,深度测序,得病,分类系统,毒株,test,统计学分析,全长,全基因组序列,有样,变数,基因组突变,有毒,肺炎患者,境外输入,输入性病例,隐匿
AB值：
0.233303
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