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典型文献
应用甲基化芯片技术研究PM 2.5对人支气管上皮细胞DNA甲基化水平影响
文献摘要:
目的:应用甲基化芯片与生物信息技术,筛选大气污染细颗粒物(PM 2.5)对人支气管上皮(HBE)细胞的差异甲基化位点及其包含的基因和通路,为进一步研究PM 2.5对HBE细胞毒理学机制提供科学依据。 方法:于2020年8月,用10 μg/ml和50 μg/ml PM 2.5水溶物染毒HBE细胞24 h,即PM 2.5 10 μg/ml染毒组(低剂量组)和PM 2.5 50 μg/ml染毒组(高剂量组);用未染毒的HBE细胞作为对照组,将DNA片段与芯片进行杂交,芯片扫描读取数据后分析数据,筛选差异甲基化位点,进行差异甲基化位点的GO分析和KEGG分析,功能表观遗传模块(FEMs)分析整体差异甲基化位点的相互作用关系。 结果:与对照组比较,低剂量组共筛选出127个差异甲基化位点,包含89个基因,其中甲基化水平升高的有55个位点,甲基化水平降低的有72个,甲基化差异位点主要集中在Body区域和UTR区域。与对照组比较,高剂量组共筛选出238个差异甲基化位点,包含168个的基因,其中甲基化水平升高的有127个位点,甲基化水平降低的有111个,其差异位点也主要集中在Body区域和UTR区域。通过FEMs分析,筛选出8个相互作用最多的基因,其中6个基因有明显甲基化水平变化。在低剂量组的甲基化差异位点中找到与细胞凋亡相关的 MALT1基因;在高剂量组的甲基化差异位点中找到与癌变相关的 PIK3CA、 ARID1A基因;在FEMs分析结果中找到与肿瘤抑制相关的 TNF基因。 结论:PM 2.5染毒HBE细胞后,引起DNA甲基化水平明显变化,筛选出细胞凋亡和癌变相关基因,提示PM 2.5致癌致突变作用可能与DNA甲基化有关。
文献关键词:
甲基化;细颗粒物;基因;人支气管上皮细胞;DNA;生物标志物
作者姓名:
李闰冰;王冰玉;秦双建;徐新云;张朝晖
作者机构:
南华大学公共卫生学院,衡阳 421001;深圳市疾病预防控制中心环境与健康所,深圳 518055;中南大学湘雅公共卫生学院,长沙 410078
引用格式:
[1]李闰冰;王冰玉;秦双建;徐新云;张朝晖-.应用甲基化芯片技术研究PM 2.5对人支气管上皮细胞DNA甲基化水平影响 )[J].中华劳动卫生职业病杂志,2022(03):177-182
A类:
大气污染细颗粒物,FEMs,MALT1
B类:
芯片技术,PM ,人支气管上皮细胞,甲基化水平,生物信息技术,HBE,甲基化位点,细胞毒理学,毒理学机制,ml,染毒,高剂量,读取数据,功能表,表观遗传,相互作用关系,个位,平降,异位,Body,UTR,水平变化,点中,癌变,变相,PIK3CA,ARID1A,肿瘤抑制,致癌,致突变,变作,生物标志物
AB值:
0.188116
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