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大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变模型视神经蛋白质组学分析
文献摘要:
目的:定量分析SD大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变(NAION)模型中视神经组织蛋白表达变化,并对差异蛋白进行生物信息学分析。方法:选取10只8周龄体质量200~250 g的SPF级雄性SD大鼠,采用孟加拉玫瑰红联合激光光动力方法建立NAION模型,最终选取4只造模成功的大鼠作为NAION模型组,同时取4只体质量和周龄相匹配的健康、无眼疾SD大鼠作为正常对照组。于造模后7 d,分离各组大鼠球后视神经,采用酶切法进行样本制备,采用同位素标记相对和绝对定量标记结合液相色谱-串联质谱技术对组织蛋白进行质谱鉴定和定量检测,选取组间表达倍数大于1.5倍且差异有统计学意义(
P<0.05)的蛋白为差异蛋白,并对差异蛋白进行生物信息学分析。
结果:造模后3 d,NAION模型组大鼠视盘隆起,荧光素眼底血管造影图像显示视盘区有荧光素钠渗漏,模型建立成功。共鉴定出1 291个可定量蛋白,其中差异蛋白80个。与正常对照组比较,NAION模型组中表达上调的蛋白5个,表达下调的蛋白75个。V型胶原α1链(Col5A1)和cAMP依赖性蛋白激酶催化亚基β(Prkacb)、G蛋白相关支架蛋白(Dlg1)等蛋白表达升高;神经微丝蛋白(Nefm)、微管相关蛋白1b(Map1b)、Ras相关蛋白(Rala)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N2(Pkn2)、血小板活化因子乙酰水解酶IB亚基(Pafah1b1)等蛋白表达降低。差异蛋白主要参与细胞骨架的调节、细胞对缺氧的反应、轴突生成及延伸、突触调节、神经元凋亡调控、轴浆运输等生物学进程。京都基因与基因组通路富集分析结果显示,差异蛋白主要参与代谢通路、突触囊泡循环、血小板活化等信号通路。结论:神经生长、能量代谢、轴浆运输及凋亡等信号通路相关蛋白的表达共同参与NAION中神经细胞的凋亡。
文献关键词:
视神经病变,缺血性;视神经;蛋白质组学
中图分类号:
作者姓名:
胡立影;李志清;邵先锋;郭小雪;于大为;东莉洁;李筱荣
作者机构:
天津医科大学眼科医院 天津医科大学眼视光学院 天津医科大学眼科研究所 国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心天津市分中心 天津市视网膜功能与疾病重点实验室 300384
文献出处:
引用格式:
[1]胡立影;李志清;邵先锋;郭小雪;于大为;东莉洁;李筱荣-.大鼠非动脉炎性前部缺血性视神经病变模型视神经蛋白质组学分析)[J].中华实验眼科杂志,2022(01):13-20
A类:
Col5A1,Prkacb,Dlg1,Nefm,Map1b,Rala,Pkn2,Pafah1b1
B类:
非动脉炎性前部缺血性视神经病变,蛋白质组学,组学分析,NAION,中视,神经组织,组织蛋白,表达变化,差异蛋白,生物信息学分析,周龄,SPF,孟加拉,玫瑰红,光动力,无眼,眼疾,正常对照,后视,样本制备,同位素标记相对和绝对定量,串联质谱技术,质谱鉴定,定量检测,倍数,视盘,隆起,荧光素眼底血管造影,盘区,荧光素钠,渗漏,立成,cAMP,依赖性蛋白激酶,酶催化,催化亚基,白相,神经微丝蛋白,微管,Ras,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,N2,血小板活化因子,水解酶,IB,细胞骨架,轴突,突生,神经元凋亡,轴浆,京都,通路富集分析,代谢通路,突触囊泡,能量代谢,神经细胞
AB值:
0.265587
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