典型文献
生物信息学筛选和分析非酒精性脂肪性肝病特征差异表达关键基因
文献摘要：
目的:应用生物信息学方法筛选和分析非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）特征差异表达关键基因。方法:GEO数据库中下载NAFLD相关的表达矩阵GSE89632，使用Limma包筛选健康样本、脂肪变性（SS）样本和非酒精性脂肪性肝炎（NASH）样本差异表达基因（DEGs），WGCNA分析输出模块基因；模块基因与差异基因取交集确定特征差异基因，随后进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。使用在线网站STRING和Cytoscape软件构建蛋白互作网络（PPI），并筛选关键（Hub）基因。最后使用R软件进行Hub基因的受试者操作特征曲线（ROC）分析。结果:经筛选共获得92个特征差异表达基因，主要富集于 “脂多糖反应和细菌起源分子反应”的炎症反应相关功能，以及“癌症中蛋白聚糖”和“T细胞白血病病毒感染相关”癌症信号通路。10个Hub基因（FOS，CXCL8，SERPINE1，CYR61，THBS1，FOSL1，CCL2，MYC，SOCS3和ATF3）具有较好的诊断价值。结论:通过生物信息学分析获得的10个NAFLD疾病相关特征差异表达Hub基因，可能成为NAFLD的诊断和预后标志物及潜在治疗靶点，有待进一步基础和临床研究验证。
文献关键词：
非酒精性脂肪性肝病;生物信息学;关键基因;诊断标志物
中图分类号：
作者姓名：
丁洁霞;黄文豹;蒋小仙;张丽旦;方洪;金洁
作者机构：
浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院，杭州 310003
文献出处：
引用格式：
[1]丁洁霞;黄文豹;蒋小仙;张丽旦;方洪;金洁-.生物信息学筛选和分析非酒精性脂肪性肝病特征差异表达关键基因)[J].中华肝脏病杂志,2022(03):297-303
A类：
GSE89632
B类：
非酒精性脂肪性肝病,特征差异,关键基因,生物信息学方法,NAFLD,GEO,下载,Limma,脂肪变性,SS,非酒精性脂肪性肝炎,NASH,差异表达基因,DEGs,WGCNA,输出模块,差异基因,交集,信号通路富集,通路富集分析,线网,STRING,Cytoscape,软件构建,蛋白互作网络,PPI,选关,Hub,受试者操作特征曲线,共获,脂多糖,相关功能,蛋白聚糖,白血病,CXCL8,SERPINE1,CYR61,THBS1,FOSL1,CCL2,MYC,SOCS3,ATF3,诊断价值,生物信息学分析,疾病相关,诊断和预后,预后标志物,潜在治疗,治疗靶点,诊断标志物
AB值：
0.349319
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