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北京地区呼吸道感染住院儿童中人博卡病毒流行病学和基因进化分析
文献摘要:
目的:分析北京地区呼吸道感染住院儿童人博卡病毒1型(human bocavirus 1,HBoV1)的流行病学特征,阐明遗传进化特点。方法:采用real-time PCR方法对2017—2019年北京友谊医院呼吸道感染住院患儿的2 848份鼻咽抽吸物样本进行HBoV1核酸检测,结合临床信息进行流行病学分析;利用巢氏PCR方法扩增HBoV1的NP1和VP1基因,分析序列同源性;构建VP1的最大分支可信度树和种群进化图,进行时间进化分析。结果:2 848份样本中检出HBoV1阳性样本90份,感染率为3.16%,5岁以下患儿居多(93.33%,84/90)。HBoV1感染全年可见,10月份病例数最多,检出率为7.23%(18/249)。HBoV1阳性病例多与其他呼吸道病毒混合感染(48.89%,44/90),临床症状多为咳嗽和发热。巢氏PCR扩增获得NP1区序列55条和VP1序列47条,核酸同源性分别为98.9%~100%和99.1%~100%。HBoV1 VP1时间进化分析显示本研究获得的HBoV1基因序列出现在两个进化分支上,HBoV1种群动态平稳。结论:HBoV1是导致北京地区儿童呼吸道感染的常见病毒之一,其基因进化相对稳定,但仍需持续监测。
文献关键词:
呼吸道感染;人博卡病毒;基因进化
中图分类号:
作者姓名:
张骞;王超;黄益曼;麻粉莲;郑丽舒
作者机构:
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室,北京 100052
文献出处:
引用格式:
[1]张骞;王超;黄益曼;麻粉莲;郑丽舒-.北京地区呼吸道感染住院儿童中人博卡病毒流行病学和基因进化分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(01):65-70
A类:
HBoV1
B类:
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AB值:
0.287146
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