典型文献
瘤背石磺磷脂酶C基因的克隆及在不同声波刺激下的表达
文献摘要:
磷脂酶C(Phospholipase C,PLC)是一类与膜蛋白相关的酶,在信号转导途径中起作用.栖息于潮间带的瘤背石磺(Onchidium reevesii)能够感知当地的潮汐规律,为了探究瘤背石磺中磷脂酶C在潮汐感知中的作用和分子机制,本实验以瘤背石磺神经环为实验材料,利用RACE-PCR技术得到了其cDNA全长,并进行生物信息学分析和实时荧光定量PCR实验.结果显示,瘤背石磺PLC基因的cDNA全长为2 578 bp,开放阅读框1 881 bp,5'非编码区337 bp,3'非编码区340 bp,并且在末端存在AATAAA加尾信号,共编码627个氨基酸;氨基酸序列比对结果显示,瘤背石磺PLC氨基酸序列与福寿螺的磷脂酶C样蛋白2氨基酸序列匹配度最高,与传统形态学的分类相吻合.在实验室内模拟潮汐产生的音波来刺激瘤背石磺,使用实时荧光定量PCR检测OrPLC基因在瘤背石磺神经环中的表达,结果显示:OrPLC在刺激声波频率为40 Hz和70 Hz的时候表达量基本稳定;声波频率为160 Hz和310 Hz时表达量较低;在声波频率为220 Hz和280 Hz时,处于高表达的状态,说明该基因在瘤背石磺的低频感知中发挥重要作用.该实验为进一步了解瘤背石磺潮汐感知功能研究奠定了理论支撑.
文献关键词:
瘤背石磺;磷脂酶C;低频声波;潮汐节律;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
杨铁柱;饶榕城;黄笑含;吴容宇;贾晶晶;沈和定
作者机构:
上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306;信阳农林学院水产学院河南省渔业生物工程技术研究中心,河南信阳 464000;上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室,上海 201306
文献出处:
引用格式:
[1]杨铁柱;饶榕城;黄笑含;吴容宇;贾晶晶;沈和定-.瘤背石磺磷脂酶C基因的克隆及在不同声波刺激下的表达)[J].上海海洋大学学报,2022(01):29-38
A类:
瘤背石磺,AATAAA,OrPLC,潮汐节律
B类:
磷脂酶,同声,Phospholipase,膜蛋白,白相,信号转导途径,栖息,潮间带,Onchidium,reevesii,实验材料,RACE,cDNA,全长,生物信息学分析,bp,开放阅读框,非编码区,加尾,氨基酸序列比对,福寿螺,序列匹配,匹配度,传统形态学,相吻合,实验室内,室内模拟,音波,环中,刺激声,声波频率,基本稳定,感知功能,功能研究,低频声波
AB值:
0.28111
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