目的:基于中药化学生物学理论,运用生物信息学分析方法对小青龙汤治疗肺系疾病的靶点群及机制进行探讨.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis plat-form,TCMSP)对小青龙汤中活性成分进行筛选,基于所筛选成分,从Swiss Target Prediction、PharmMapper预测成分相关靶点.同时用DisGeNET、GeneCards和CTD数据库收集肺系疾病相关靶点,通过成分靶点和疾病靶点映射分析,运用STRING数据库对交集靶点群进行蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)分析,应用Metascape和DAVID在线分析平台对交集靶点群进行基因本体论(gene ontology,GO)生物过程和KEGG通路富集分析,使用SYBYL-X2.0软件对分析结果进行分子对接验证.结果:获得2个靶点群,分别涉及63个和160个靶点.PPI网络分析显示,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、TP53和肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等靶点具有较高的度值;GO生物学过程主要涉及促分裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK1)级联的调控、一氧化氮(nitric oxide,NO)生物合成和炎症反应等;KEGG通路富集分析显示,PI3K-AKT信号通路具有较高的度值;分子对接结果显示,槲皮素和MAPK、VEGFA、CDK2、PTK2靶点的对接得分较高.结论:小青龙汤可能通过调控PI3K-AKT信号通路及其相关靶点发挥治疗肺系疾病的作用.

小青龙汤;肺系疾病;靶点群;中药化学生物学;《伤寒论》;张仲景

孙庆生;黄彭;曲佳琳;李希;张姗

郑州市中医院,河南郑州450000;大连医科大学附属第一医院中西医结合临床重点学科实验室,辽宁大连116011;河南睢县人民医院,河南睢县476900;潍坊市中医院,山东潍坊261000;河南中医药大学第一附属医院,河南郑州450000

河南中医

[1]孙庆生;黄彭;曲佳琳;李希;张姗-.基于中药化学生物学理论探讨小青龙汤在肺系疾病中的靶点群及作用机制)[J].河南中医,2022(02):167-176

中药化学生物学,mitogenactivated

理论探讨,小青龙汤,肺系疾病,靶点群,生物信息学分析,系统药理学,分析平台,traditional,chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,plat,form,TCMSP,活性成分,选成,Swiss,Target,Prediction,PharmMapper,DisGeNET,GeneCards,CTD,疾病相关,STRING,交集靶点,蛋白质互作网络,protein,interaction,PPI,Metascape,DAVID,在线分析,基因本体论,gene,ontology,生物过程,通路富集分析,SYBYL,X2,分子对接,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,serine,threonine,kinase,AKT1,血管内皮生长因子,vascular,endothelial,growth,VEGFA,Interleukin,TP53,tumor,necrosis,生物学过程,促分裂原,MAPK1,一氧化氮,nitric,oxide,生物合成,PI3K,槲皮素,CDK2,PTK2,接得,伤寒论,张仲景

0.370075