首站-论文投稿智能助手
典型文献
基于生物信息学数据库探讨高迁移率族蛋白B-1影响结直肠癌预后的机制
文献摘要:
目的 通过生物信息学数据库观察高迁移率族蛋白B-1(HMGB-1)与临床病理特征、肠道菌群的关系,探讨其影响结直肠癌患者预后是否与肠道菌群失衡有关.方法 收集公共基因芯片(GEO)数据库中3个结直肠癌数据集的临床资料,分析其与结直肠癌临床特征及预后的关系.选择河北北方学院附属第一医院2021年5月至11月88例结直肠癌患者,检测其血清标本中HMGB-1的表达,并以最佳截断值为界将标本分为HMGB-1H组和HMGB-1L组,从两组中各选取10例患者粪便进行16SrDNA序列测序.结果 ROC曲线显示,数据库中HMGB-1水平预测结直肠癌预后的曲线下面积(AUC)为0.583,HMGB-l的最佳截断值为10.24 ng/ml.与HMGB-1L相比,HMGB-1H的患者TNM分期较晚,总生存期短,易复发和转移(P<0.05),且高HMGB-1水平及和TNM分期是结直肠癌患者死亡的独立危险因素(P<0.05).两组患者的16S rDNA测序结果提示HMGB-1H组与HMGB-1L组的菌群组成有一定的相似性;两两比较,在门水平,HMGB-1H组主要以厚壁菌门为主,而HMGB-1L组主要以变形杆菌门为主.在属水平,HMGB-1L发现普罗威登斯菌属富集.Tax4Fun功能预测显示,两者差异菌群的功能富集多集于DNA损伤修复功能,糖酵解、氨基酸代谢等.结论 HMGB-1的升高与结直肠癌的预后差密切相关.HMGB-1的升高可能导致普罗威登斯菌属的减少而影响结直肠癌的预后,机制与结直肠癌的癌细胞DNA损伤修复及其代谢等有关.
文献关键词:
结直肠癌;高迁移率族蛋白B-1;肠道菌群;普罗威登斯菌属
作者姓名:
陈安祺;原娜;赵威威;郝晓慧;王聪;卢秀荣;宋晓;张志林
作者机构:
河北北方学院研究生院,河北张家口 075000;河北北方学院附属第一医院放射治疗科,河北张家口 075000
文献出处:
引用格式:
[1]陈安祺;原娜;赵威威;郝晓慧;王聪;卢秀荣;宋晓;张志林-.基于生物信息学数据库探讨高迁移率族蛋白B-1影响结直肠癌预后的机制)[J].中国临床研究,2022(11):1533-1539
A类:
B类:
高迁移率族蛋白,HMGB,临床病理特征,结直肠癌患者,肠道菌群失衡,基因芯片,GEO,血清标本,截断值,1H,1L,患者粪便,16SrDNA,ml,TNM,总生存期,菌群组成,厚壁菌门,变形杆菌,普罗威登斯菌属,Tax4Fun,功能预测,功能富集,多集,损伤修复,修复功能,糖酵解,氨基酸代谢,癌细胞
AB值:
0.167971
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。