典型文献
基于文本挖掘和生物医学数据库的新型冠状病毒肺炎药物发现
文献摘要：
目的 基于文本挖掘技术和生物医学数据库对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关文献进行数据挖掘分析,探究COVID-19及其主要症状发热、咳嗽、呼吸障碍相关基因靶点,筛选潜在有效的化学药和中药.方法 使用GenCLiP 3网站获取COVID-19和其主要症状咳嗽、发热、呼吸障碍共4个关键词的共有靶点,在METASCAPE数据库中对其进行基因本体(GO)和通路富集分析,再利用String数据库和Cytoscape软件构建共有靶点的蛋白质相互作用网络,筛选获得核心基因,运用DGIdb数据库、SymMap数据库针对核心基因进行中西医治疗药物预测.结果 获得COVID-19及其主要症状共有基因靶点28个,其中有IL2、IL1B、CCL2等核心基因16个,使用DGIdb数据库筛选获得与16个关键靶点相互作用的化学药包括沙利度胺、来氟米特、环孢素等28种,中药包括虎杖、黄芪、芦荟等70味.结论 COVID-19及其主要症状的病理机制可能和CD4、KNG1、VEGFA等28个共有基因相关,可能通过介导TNF、IL-17等信号通路参与COVID-19病理过程.潜在有效药物可能通过作用相关靶点通路起到治疗COVID-19的作用.
文献关键词：
新型冠状病毒肺炎;文本挖掘;生物医学数据库;药物发现;发热;咳嗽;呼吸障碍
中图分类号：
作者姓名：
李彦波;赵鑫;吕文良;武庆娟;曹正民;强睿;张丽丽
作者机构：
北京中医药大学研究生院,北京100029;中国中医科学院广安门医院感染疾病科,北京100053
文献出处：
引用格式：
[1]李彦波;赵鑫;吕文良;武庆娟;曹正民;强睿;张丽丽-.基于文本挖掘和生物医学数据库的新型冠状病毒肺炎药物发现)[J].药物评价研究,2022(01):37-47
A类：
METASCAPE
B类：
生物医学数据库,药物发现,文本挖掘技术,挖掘分析,主要症状,咳嗽,呼吸障碍,基因靶点,化学药,GenCLiP,基因本体,通路富集分析,String,Cytoscape,软件构建,蛋白质相互作用网络,核心基因,DGIdb,SymMap,中西医治疗,治疗药物,药物预测,IL2,IL1B,CCL2,关键靶点,沙利度胺,来氟米特,环孢素,中药包,虎杖,黄芪,芦荟,病理机制,CD4,KNG1,VEGFA,病理过程
AB值：
0.320196
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