典型文献
AFEchidna—动植物育种数据遗传评估分析的R程序包
文献摘要：
子代测定是动植物育种中的关键环节,一般使用混合线性模型基于限制性最大似然(restricted maximum likehood,REML)法来估算子代测定数据中随机效应的方差分量,并估计固定效应(最佳线性无偏估计,BLUEs)和预测随机效应(最佳线性无偏预测,BLUPs).当前动植物遗传评估的先锋软件是ASReml,但其是商业软件,费用昂贵.虽然有如Echidna或R程序包sommer等免费软件,但是Echidna软件用法复杂,而R程序包功能有限.因此本研究利用R语言基于Echidna软件编写R程序包AFEchidna,方便用户通过该程序包使用混合线性模型不仅可求解方差分量、遗传参数和随机效应BLUP值,还可进行多个性状、多个方差结构和多个遗传参数的批量分析,不同模型间的比较以及基因组BLUP分析.开发AFEchidna包来壮大遗传评估免费软件,并期望其效率能接近于商业软件.
文献关键词：
REML;方差分量;遗传参数;批量分析
中图分类号：
作者姓名：
肖丽娜;魏瑞研;谭芷茵;张卫华;林元震
作者机构：
广东省森林培育与保护利用重点实验室/广东省林业科学研究院,广东广州 510520;华南农业大学/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东广州510642
文献出处：
引用格式：
[1]肖丽娜;魏瑞研;谭芷茵;张卫华;林元震-.AFEchidna—动植物育种数据遗传评估分析的R程序包)[J].林业与环境科学,2022(05):50-56
A类：
AFEchidna,likehood,BLUEs,BLUPs,Echidna,sommer
B类：
动植物,植物育种,育种数据,遗传评估,评估分析,程序包,子代测定,一般使用,混合线性模型,限制性,最大似然,restricted,maximum,REML,随机效应,方差分量,固定效应,无偏估计,最佳线性无偏预测,ASReml,商业软件,昂贵,有如,免费软件,研究利用,可求,遗传参数,批量分析
AB值：
0.294417
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