典型文献
生物信息学分析IGF-2R在乳腺癌中的作用机制
文献摘要：
目的 确定IGF-2R基因对乳腺癌的调控作用,挖掘参与乳腺癌发生发展潜在的基因及通路.方法 利用"GEOquery""idmap2.0""Limma""Clusterprolifer"等R包筛选乳腺肿瘤组织与正常组织的差异表达基因,并进行GO和KEGG分析.采用STRING、GEPIA和UALACN数据库绘制蛋白互作网络,分析IGF-2R基因与乳腺癌Hub基因的相关性,以及IGF2R表达水平与乳腺癌患者基本情况的相关性.结果 筛选得到128个上调差异表达基因,256个下调差异表达基因;IGF-2R基因与核心基因ASPM、RRM2相关性显著;IGF-2R基因表达水平在乳腺癌组织中显著降低,差异有统计学意义(P<0.05);IGF-2R表达水平与患者年龄(20～80岁)、临床分期(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)、绝经情况和淋巴结转移密切相关,差异有统计学意义(P<0.05).IGF-2R基因的表达水平仅在Luminal型(LuminalA型、Luminal B-HER2阴性型)乳腺癌中显著降低,差异有统计学意义(P<0.05).结论 IGF-2R通过与ASPM和RRM2正相关参与乳腺癌的调控作用,有望为乳腺癌的防治提供新的思路.
文献关键词：
乳腺癌;生物信息学;胰岛素样生长因子受体2
中图分类号：
作者姓名：
肖海燕;王潇;曹中伟
作者机构：
包头医学院,内蒙古 包头 014040;内蒙古自治区人民医院内镜中心,内蒙古 呼和浩特 010017;内蒙古自治区人民医院甲乳疝外科,内蒙古 呼和浩特 010017
文献出处：
引用格式：
[1]肖海燕;王潇;曹中伟-.生物信息学分析IGF-2R在乳腺癌中的作用机制)[J].内蒙古医科大学学报,2022(04):347-352
A类：
GEOquery,idmap2,Clusterprolifer,UALACN,IGF2R
B类：
生物信息学分析,Limma,乳腺肿瘤,肿瘤组织,正常组织,差异表达基因,STRING,GEPIA,蛋白互作网络,Hub,乳腺癌患者,选得,调差,核心基因,ASPM,RRM2,基因表达水平,癌组织,患者年龄,临床分期,绝经,淋巴结转移,LuminalA,HER2,胰岛素样生长因子
AB值：
0.219414
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