典型文献
初发类风湿关节炎患者肠道微生物群落的基因组学特征分析
文献摘要:
目的 探究初发类风湿关节炎(RA)患者肠道微生物群落的基因组学(Genomics)特征.方法 收集住院的30例初发类风湿关节炎患者(RA组)和30例健康人(对照组)的晨起粪便,收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,应用ION TORRENT高通量测序平台对16S rDNA基因的V2、V3、V4、V6、V7、V8、V9可变区开展测序,得出2组试验对象的菌群生物信息数据,再基于文献智库信息,对数据进行组间OTU分析、Alpha菌群多样性分析以及LEfSe差异分析.结果 相较于健康对照组,在OTU菌群丰度上,初发RA组呈显著降低.借助Shannon指数等完成稀释曲线,同时分析数据复杂度,结果表明,所测的数据量完整,能够反映样本中各微生物的多样性信息.菌群多样性比较得出:2组多样性指数分析中Chao1指数、Simpson指数、Goods_coverage指数、Observe_species指数比较,差异无统计学意义(P>0.05).与对照组相比,Shannon指数较初发RA组偏小.菌群结构和菌群差异分析得出:2组在门水平和科水平及属水平上,差异具有统计学意义(P<0.05),初发RA患者组放线菌门(Acti-nobacteria)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、厚壁菌科(Clostridiales Family ⅩⅢ Incertae Sedis)丰度较健康对照组增加(P<0.05);初发RA患者组木假单胞菌属(Paraprevotella)、Tyzzerella属、类杆菌属(Coprobacter)相对丰度与健康对照组相比明显减少(P<0.05).结论 初发RA患者肠道菌群丰富度、多样性明显低于健康人,部分菌群存在明显差异,今后调节肠道正常菌群将为类风湿关节炎的治疗开辟新路径.
文献关键词:
类风湿关节炎;肠道微生物群落;淋巴细胞亚群;TNF-α;IL-6
中图分类号:
作者姓名:
马晓莉;郝春芳;郭东更;吴丽丽;张明珠;杨亚珊;陈坤婷;张英强;徐天宇;殷喆;郭江涛
作者机构:
宁夏回族自治区人民医院风湿免疫科,宁夏银川750002;宁夏医科大学,宁夏银川750004
文献出处:
引用格式:
[1]马晓莉;郝春芳;郭东更;吴丽丽;张明珠;杨亚珊;陈坤婷;张英强;徐天宇;殷喆;郭江涛-.初发类风湿关节炎患者肠道微生物群落的基因组学特征分析)[J].宁夏医学杂志,2022(09):803-806
A类:
初发类风湿关节炎,TORRENT,Coprobacter
B类:
类风湿关节炎患者,肠道微生物群落,基因组学,RA,Genomics,健康人,每份,粪便样品,ION,高通量测序平台,16S,rDNA,V2,V3,V4,V6,V7,V8,V9,可变区,群生,信息数据,智库,OTU,Alpha,菌群多样性,多样性分析,LEfSe,菌群丰度,Shannon,数据量,量完,多样性指数,指数分析,Chao1,Simpson,Goods,coverage,Observe,species,指数比较,菌群结构,菌群差异,放线菌,Acti,nobacteria,双歧杆菌,Bifidobacteriaceae,厚壁菌,Clostridiales,Family,Incertae,Sedis,假单胞菌属,Paraprevotella,Tyzzerella,杆菌属,相对丰度,肠道菌群,丰富度,后调,淋巴细胞亚群
AB值:
0.366871
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