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基于加权基因共表达网络分析法筛选多囊卵巢综合征Hub基因
文献摘要：
目的 多囊卵巢综合征(PCOS)常伴有肥胖表现,探索调控PCOS患者肥胖的关键基因,有益于肥胖型PCOS的诊断与防治.方法 从GEO数据库中下载肥胖型PCOS患者和肥胖非PCOS患者转录组数据,运用加权基因共表达网络分析法(WGCNA)筛选出与PCOS发生发展相关的关键模块,用GO及KEGG对模块功能进行富集分析,进一步挖掘出与PCOS发生发展相关联的中枢基因(Hub gene).结果 WGCNA一共定义了13个基因共表达模块,从其中4个模块中筛选出与肥胖PCOS相关的189个差异表达基因,这些基因主要被富集到免疫相关的TNF-α和IL-17信号通路,从中最终筛选出PTGS2、IL6、CXCL8、CXCL2、IL1B、S100A9、S100A8、CCL2、ICAM1、LIF、TNFRSF1B和IRF112个Hub基因.结论 本研究筛选出与肥胖PCOS相关的关键基因,并进一步聚类到免疫相关信号通路,提示肥胖型PCOS与免疫应答存在相关性.
文献关键词：
多囊卵巢综合征;Hub基因;加权基因共表达网络分析;免疫信号通路
中图分类号：
作者姓名：
陈莉;邹铸;徐靖原;沈梦溪;李俊;姚新生
作者机构：
遵义医科大学 免疫学教研室,贵州 遵义 563099;遵义医科大学附属医院 医学检验科,贵州 遵义 563099
文献出处：
引用格式：
[1]陈莉;邹铸;徐靖原;沈梦溪;李俊;姚新生-.基于加权基因共表达网络分析法筛选多囊卵巢综合征Hub基因)[J].遵义医科大学学报,2022(04):491-497
A类：
TNFRSF1B,IRF112
B类：
加权基因共表达网络分析,网络分析法,多囊卵巢综合征,Hub,PCOS,关键基因,有益于,肥胖型,诊断与防治,GEO,下载,转录组数据,WGCNA,模块功能,富集分析,挖掘出,相关联,中枢基因,gene,一共,差异表达基因,PTGS2,IL6,CXCL8,CXCL2,IL1B,S100A9,S100A8,CCL2,ICAM1,LIF,免疫相关信号通路,免疫应答,免疫信号通路
AB值：
0.29979
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