典型文献
石斛碱抗脑缺血再灌注损伤的网络药理学研究
文献摘要：
目的 基于网络药理学研究石斛碱抗脑缺血再灌注损伤(CIRI)的作用机制.方法 通过数据库Pharmmapper、BATMAN-TCM和GeneCards分别对石斛碱及疾病靶点进行预测,利用VENNY2.1.0进行映射得到石斛碱作用于CIRI的潜在靶点,再导入Cytoscape3.8.2软件构建蛋白-蛋白交联互作网络(PPI).利用R语言的clusterProfiler软件包对石斛碱抗脑缺血再灌注损伤的潜在靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因及基因组百科全书(KEGG)富集通路分析.结果 找到石斛碱相关靶点214个,脑缺血再灌注损伤相关靶点513个,交集靶点58个,PPI分析度值排名前10的核心靶基因有ALB、MAPK1、MAPK8、CASP3、IGF1、SRC、NOS3、MMP2、HSP90AA1和ESR1.通过KEGG富集通路分析得到14条显著通路,与相关文献检索报道有关的为Rap1信号通路、MAPK信号通路、趋化因子(chemokine)信号通路等.结论 石斛碱通过多靶点、多途径治疗CIRI,其可能主要通过炎症、凋亡等途径起到抗CIRI的作用.
文献关键词：
石斛碱;脑缺血再灌注;网络药理学
中图分类号：
作者姓名：
刘晓莉;刘胜伟;廖原;曾凡平;刘洁
作者机构：
重庆市永川区中医院内科,重庆 402160;重庆医科大学附属永川医院,重庆 402160;杭州师范大学生命与环境科学学院,浙江 杭州310036;重庆市江津区中心医院,重庆 402260
文献出处：
引用格式：
[1]刘晓莉;刘胜伟;廖原;曾凡平;刘洁-.石斛碱抗脑缺血再灌注损伤的网络药理学研究)[J].中国药物警戒,2022(03):252-258
A类：
VENNY2
B类：
石斛碱,脑缺血再灌注损伤,网络药理学,药理学研究,CIRI,Pharmmapper,BATMAN,TCM,GeneCards,潜在靶点,Cytoscape3,软件构建,蛋白交联,互作网络,PPI,clusterProfiler,软件包,基因本体,Ontology,富集分析,京都,百科全书,富集通路,通路分析,交集靶点,靶基因,ALB,MAPK1,MAPK8,CASP3,IGF1,SRC,NOS3,MMP2,HSP90AA1,ESR1,文献检索,Rap1,趋化因子,chemokine,多靶点,多途径
AB值：
0.294807
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