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典型文献
基于lncRNA相关ceRNA网络预测冠心病血瘀证分子调控轴
文献摘要:
目的 通过长链非编码RNA(lncRNA)相关竞争性内源RNA(ceRNA)网络构建及分析,探讨冠心病血瘀证发生发展机制.方法 通过HMDD、DisGeNET、OMIM、GeneCards、TTD、lncRNADisease数据库查找冠心病血瘀证相关基因,并通过starBase平台构建lncRNA相关ceRNA网络,采用MCODE、MCL、GLay方法识别功能模块,基于最小结构熵确定最优模块识别方法,筛选包含lncRNA、miRNA、mRNA的模块,通过文献预测模块中潜在的调控轴.结果 ceRNA网络共有283个节点,由72个miRNA、182个mRNA、29个lncRNA和4990个调控关系组成,共划分为11个功能模块,发现UCA1-miR-1-G6PD调控轴,其中miR-1抑制G6PD表达导致冠状动脉疾病的发生,而UCA1能够解除miR-1的抑制从而恢复G6PD正常表达.结论 UCA1-miR-1-G6PD分子调控轴与冠心病血瘀证相关;可通过ceRNA网络的模块化分析开展病证相关研究.
文献关键词:
冠心病;血瘀证;竞争性内源RNA;长链非编码RNA;调控轴;模块药理学
作者姓名:
王念;王博;冷媛媛;祁轶斐;李兵;张莹莹;雷蕾;王忠;刘骏
作者机构:
中国中医科学院中医临床基础医学研究所,北京 100700;中国中医科学院中药研究所,北京 100700;北京中医药大学东直门医院,北京 100700;中国中医科学院中医药信息研究所,北京 100700
引用格式:
[1]王念;王博;冷媛媛;祁轶斐;李兵;张莹莹;雷蕾;王忠;刘骏-.基于lncRNA相关ceRNA网络预测冠心病血瘀证分子调控轴)[J].中国中医药信息杂志,2022(12):38-45
A类:
HMDD,lncRNADisease,GLay,模块药理学
B类:
ceRNA,冠心病血瘀证,分子调控,调控轴,长链非编码,竞争性,网络构建,发展机制,DisGeNET,OMIM,GeneCards,TTD,starBase,平台构建,MCODE,MCL,方法识别,识别功能,功能模块,小结,结构熵,miRNA,UCA1,G6PD,冠状动脉疾病,模块化分析,病证
AB值:
0.255873
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