典型文献
珠江河口水体环境DNA提取方法的建立及优化
文献摘要:
近年来,环境DNA(eDNA)技术广泛应用于水生生物多样性研究.以珠江河口咸淡水生态系统为研究区域,采用滤膜法富集eDNA,选取直径47 mm、孔径0.45 μm的硝酸纤维膜、醋酸纤维膜、玻璃纤维膜和聚碳酸酯膜共4种材质的滤膜,采用4种滤膜保存方法,结合2种试剂盒提取eDNA,评估不同组合方案对eDNA提取效果的影响.结果显示,滤膜材质和保存方法对eDNA产量具有显著影响;其中,醋酸纤维膜获取的eDNA浓度最高.在DNA提取物质量相当的情况下,海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒提取的eDNA浓度高于DNeasy Blood and Tissue kit试剂盒.在不同保存条件下,"液氮"保存法获取的eDNA浓度最高.在不具备冷冻条件时,可添加乙醇,常温保存滤膜.采样后立即过滤水样能够有效防止eDNA降解.文章建立了珠江口咸淡水生态系统水样eDNA的获取、保存和提取方案,可为相似水域的eDNA研究提供参考.
文献关键词:
珠江河口;eDNA获取;eDNA保存;eDNA提取
中图分类号:
作者姓名:
李红婷;张帅;邹柯姝;陈作志;陈晓雷;蒋佩文;曹漪婷;李敏
作者机构:
中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部外海渔业可持续利用重点实验室/广东省渔业生态环境重点实验室,广东广州510300;南方海洋科学与工程广东省实验室(广州),广东广州511458;广东珠江口生态系统野外科学观测研究站,广东广州510300;上海海洋大学海洋科学学院,上海201306;华南农业大学海洋学院,广东广州510642;大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023
文献出处:
引用格式:
[1]李红婷;张帅;邹柯姝;陈作志;陈晓雷;蒋佩文;曹漪婷;李敏-.珠江河口水体环境DNA提取方法的建立及优化)[J].南方水产科学,2022(03):30-37
A类:
醋酸纤维膜
B类:
珠江河口,口水,水体环境,eDNA,水生生物,多样性研究,咸淡水,淡水生态系统,滤膜法,玻璃纤维,聚碳酸酯,保存方法,试剂盒,不同组合,组合方案,提取效果,物质量,海洋动物,动物组织,DNeasy,Blood,Tissue,kit,保存条件,液氮,常温保存,水样,珠江口,似水,水域
AB值:
0.266529
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。