典型文献
rpoB、gyrA、cheA基因在芽孢杆菌鉴定上的应用
文献摘要：
为确定rpoB、gyrA和cheA基因在芽孢杆菌近缘种鉴定上的有效性,通过Blast-N算法,比对菌肥常用芽孢杆菌模式菌16S rRNA、rpoB、gyrA、cheA基因的序列差异,确定其应用效力.据此,提出一种根据菌株原始信息选择对应的基因引物扩增其序列,通过序列相似度和系统发育树快速、准确鉴定芽孢杆菌菌种的方法,并以19株可用于微生物肥料生产的芽孢杆菌分离株为材料,验证该方法的可行性.结果显示:地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)与枯草芽孢杆菌亚种(Bacillus subtilis subsp.subtilis、Bacillus subtilis subsp.inaquo-sorum、Bacillus subtilis subsp.spizizenii)、解淀粉芽孢杆菌亚种(Bacillus amyloliquefaciens、Bacillus velezensis)之间rpoB、gyrA、cheA基因序列的一致性分别为84.93％ ～86.57％、低于78.21％和78.25％ ～78.58％,枯草芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌亚种之间gyrA基因序列的一致性为81.01％ ～95.82％,cheA基因序列的一致性为94.50％ ～95.83％,蜡样芽孢杆菌亚种(Bacillus cereus、Bacillus thuringiensis)之间gyrA基因序列的一致性为94.54％,巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)和阿氏芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai)cheA基因序列的一致性为94.55％.序列差异表明,rpoB、gyrA和cheA基因可以区分地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌组和解淀粉芽孢杆菌组,gyrA和cheA基因可以鉴定出枯草芽孢杆菌组、解淀粉芽孢杆菌组的亚种,gyrA基因能够鉴定蜡样芽孢杆菌组的亚种,cheA基因能区分巨大芽孢杆菌和阿氏芽孢杆菌.应用所提方法,将19株芽孢杆菌分离株鉴定为茹氏短芽孢杆菌(Brevibacillus reuszeri)、Bacillus mesonae、五大连池芽孢杆菌(Bacillus wudalianchiensis)、大猩猩芽孢杆菌(Bacillus massiliogorillae)、枯草芽孢杆菌枯草亚种(Bacillus subtilis subsp.subtilis)、蜡样芽孢杆菌、阿氏芽孢杆菌和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis).
文献关键词：
芽孢杆菌;鉴定;rpoB基因;gyrA基因;cheA基因
中图分类号：
作者姓名：
颜静婷;乔凯;蔡燕飞
作者机构：
华南农业大学 资源环境学院,广东 广州510642
文献出处：
引用格式：
[1]颜静婷;乔凯;蔡燕飞-.rpoB、gyrA、cheA基因在芽孢杆菌鉴定上的应用)[J].浙江农业学报,2022(01):128-140
A类：
cheA,inaquo,sorum,spizizenii,reuszeri,mesonae,wudalianchiensis,massiliogorillae
B类：
rpoB,gyrA,近缘种,Blast,菌肥,16S,rRNA,序列差异,信息选择,引物,系统发育树,菌种,微生物肥料,分离株,地衣芽孢杆菌,Bacillus,licheniformis,subtilis,subsp,解淀粉芽孢杆菌,amyloliquefaciens,velezensis,基因序列,蜡样芽孢杆菌,cereus,thuringiensis,巨大芽孢杆菌,megaterium,阿氏芽孢杆菌,aryabhattai,Brevibacillus,五大连池,大猩猩,枯草芽孢杆菌枯草亚种,贝莱斯芽孢杆菌
AB值：
0.178036
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