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典型文献
基底膜相关基因模型预测前列腺癌患者生化复发
文献摘要:
目的:构建和验证前列腺癌(PCa)基底膜的关键基因模型,以预测PCa进展和根治性前列腺切除术后生化复发.方法:根据肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中有关PCa的相关转录组数据、基因突变数据和临床数据,分析正常前列腺组织及PCa组织间基底膜相关基因中的差异表达基因(DEG),并进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析.筛选DEG中预后相关基因,分析其突变情况.根据根治性前列腺切除术后随访情况和生化复发,构建预后风险评分模型.使用基因表达综合(GEO)数据库验证模型的准确性,对模型进行生存分析、主成分分析(PCA)、独立预后分析并构建接受者操作特征(ROC)曲线.免疫组化结果验证模型正确性,构建蛋白互作网络.构建列线图、ROC曲线和校准曲线验证列线图的准确性.结果:共筛选出 85 个DEG,其中上调基因 18 个,下调基因67 个.以其中 11 个基因构建模型,高危组患者发生生化复发的风险高于低危组(HR:3.51,95%CI:2.32~5.32,P<0.001).使用 GEO 数据库数据验证发现,高危组患者发生生化复发的风险显著高于低危组(P<0.001).此外,高危组患者的年龄更大、临床T分期更高、Gleason评分更高、淋巴结阳性率及阳性淋巴结数目更高、残留肿瘤比例更高(P均<0.05).使用患者年龄、pN分期、pT分期、cT分期、Gleason评分及预后风险评分构建了列线图,其ROC曲线下面积高于其他预测指标,校准图显示预测结果和实际结果的一致性.结论:本研究建立了基底膜相关基因预后风险评分模型,并构建了有效的列线图,可预测接受根治性前列腺切除术的PCa患者生化复发的风险.
文献关键词:
前列腺癌;生化复发;基底膜;细胞外基质
作者姓名:
王祖恒;刘喆;赵晓东;胡恩艳;陈宇豪;徐晓峰;夏菁;刘有黄;董杰;许松;程文
作者机构:
南京医科大学金陵临床医学院,江苏 南京 210002;南京大学医学院附属金陵医院/东部战区总医院泌尿外科,江苏 南京 210002;南京大学医学院附属金陵医院/东部战区总医院麻醉科,江苏 南京 210002
文献出处:
引用格式:
[1]王祖恒;刘喆;赵晓东;胡恩艳;陈宇豪;徐晓峰;夏菁;刘有黄;董杰;许松;程文-.基底膜相关基因模型预测前列腺癌患者生化复发)[J].中华男科学杂志,2022(12):1071-1079
A类:
B类:
基底膜,前列腺癌患者,生化复发,PCa,关键基因,根治性前列腺切除术,肿瘤基因组图谱,TCGA,转录组数据,基因突变,变数,临床数据,前列腺组织,差异表达基因,DEG,功能富集分析,通路富集分析,预后相关基因,术后随访,预后风险评分模型,GEO,验证模型,生存分析,预后分析,接受者,操作特征,免疫组化,蛋白互作网络,列线图,校准曲线,构建模型,数据验证,Gleason,淋巴结阳性率,阳性淋巴结,患者年龄,pN,pT,cT,预测指标,细胞外基质
AB值:
0.222721
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