目的 比较小鼠前成骨细胞(MC3T3-E1)实验组(MC3-E1-in)与对照组(MC3-E1-NC-in)的蛋白质组学差异水平,以初步探究miR-381-3p所介导的靶蛋白和相关信号通路以及差异蛋白生物学功能分析.方法 通过细胞慢病毒转染构建实验模型,分为实验组与对照组;实时荧光定量PCR验证miR-381-3p在细胞中的转染效率;收集细胞样品并采用非标记定量蛋白质组学技术进行鉴定、筛选与分析;进行组间比较得到差异蛋白(differentially expressed proteins,DEPs)表达结果,绘制火山图与表达聚类分析图以及功能富集分析差异蛋白质谱,重点分析基因本体论(geneontology,GO)富集结果、KEGG富集结果以及string-db软件预测可能的蛋白质-蛋白质相互作用结果,并对差异显著的蛋白质进行生物信息学整合分析.结果 共鉴定到4764种差异表达蛋白,其中527种差异显著并具有统计学意义,表达上调的有357种,有170种则是表达下调;GO富集结果分析显示差异蛋白主要参与生物过程的跨膜转运、蛋白水解、细胞内蛋白质转运,还参与了细胞骨架、内质网、线粒体的分子功能过程以及参与钙离子结合、蛋白激酶活性、RNA结合等细胞组分过程.结论 己糖激酶2、驱动蛋白样蛋白22、cAMP调节的磷酸化蛋白19和脂滴包被蛋白2等差异蛋白可能参miR-381-3p调控肌肉-骨骼系统代谢疾病的发生发展过程.

肌少-骨质疏松症;MC3T3-E1细胞样品;非标记定量蛋白质组学;生物信息学分析

陈锦成;朱国涛;秦晓飞;陈彦丞;罗骏;余博飞;吴宜璟;徐杰

福建中医药大学中医骨伤及运动康复教育部重点实验室,福建 福州350122;福建省立医院骨二科,福建医科大学,福建 福州350001

中国骨质疏松杂志

[1]陈锦成;朱国涛;秦晓飞;陈彦丞;罗骏;余博飞;吴宜璟;徐杰-.利用Label-free技术筛选MC3T3-E1细胞中miR-381-3p介导的靶蛋白和差异蛋白生物学功能分析)[J].中国骨质疏松杂志,2022(02):192-198

geneontology

Label,free,技术筛选,MC3T3,E1,miR,3p,靶蛋白,生物学功能分析,小鼠前成骨细胞,NC,过细,慢病毒转染,实验模型,转染效率,非标记定量蛋白质组学,蛋白质组学技术,differentially,expressed,proteins,DEPs,火山图,析图,功能富集分析,差异蛋白质,基因本体论,集结,string,db,软件预测,蛋白质相互作用,整合分析,种差,差异表达蛋白,生物过程,跨膜转运,蛋白水解,蛋白质转运,细胞骨架,内质网,钙离子,离子结合,蛋白激酶,激酶活性,分过,己糖激酶,驱动蛋白,cAMP,磷酸化,脂滴,包被,骨骼系统,系统代谢,代谢疾病,骨质疏松症,生物信息学分析

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