典型文献
高通量测序研究鸡(从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构
文献摘要：
对鸡(从)菌(Termitomyces sp.)生长的表层土(St,5 cm)、中层土(Sm,5 cm)、里层土(Si,5 cm)以及巢腔壁(Cw)和菌圃(Fc)样本进行细菌16 SrDNA高通量测序,分析样本间细菌群落结构的变化.共获得567379条质控序列,这些序列按照相似度大于97％为一类的标准,被归为3202个操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),这些OTUs又被分为40个门、96个纲、194个目、352个科、621个属.在门水平,变形杆菌(Proteobacteria)等11个门在菌圃近周土壤中的相对丰度都大于1％,总占比大于97％;在巢腔壁和菌圃中也均为主体菌.在属水平,305个属为样本共有,其中Burkholderia-ParaBurkholderia在巢腔壁和菌圃中占绝对优势,相对丰度分别达43.89％和37.58％;BradyRhizobium仅在菌圃中相对丰度(24.82％)较高;Acidobacteria_c_norank则是近周土壤中的优势属,相对丰度范围12.55％～13.41％.在OTU水平,OTU 2694、OTU 2822、OTU 2881在巢腔壁和菌圃中相对丰度(6.49％、3.73％、4.98％)较高.总体上讲,3个土壤层(St、Sm、Si)中的细菌类群相对丰度相近,巢腔壁、菌圃与土壤层相比差异较大,相对丰度较高的细菌类群对维持菌圃和巢腔壁微生态系统可能发挥重要作用.
文献关键词：
鸡(从)菌;菌圃;土壤;高通量测序;细菌群落结构
中图分类号：
作者姓名：
张明星;李洁;余萍;刘婷婷;谢娟;刘玲;徐学锋
作者机构：
华南农业大学食品学院,广东广州510642;民权县综合检验检测中心,河南商丘476000;黔西南州农业技术推广中心,贵州黔西南布依族苗族自治州562400
文献出处：
引用格式：
[1]张明星;李洁;余萍;刘婷婷;谢娟;刘玲;徐学锋-.高通量测序研究鸡(从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构)[J].食用菌学报,2022(04):17-27
A类：
ParaBurkholderia,BradyRhizobium
B类：
菌圃,土壤细菌群落结构,Termitomyces,sp,St,中层,Sm,里层,Si,腔壁,Cw,Fc,SrDNA,共获,质控,操作分类单元,operational,taxonomic,units,OTUs,变形杆菌,Proteobacteria,相对丰度,绝对优势,Acidobacteria,norank,优势属,土壤层,细菌类群,微生态系统
AB值：
0.286502
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