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典型文献
前列腺癌相关免疫基因预后生物标志物的筛选研究
文献摘要:
目的 前列腺癌(Prostatic Cancer,PCa)在老年男性中的发病率很高.到目前为止,还没有免疫标志物可用于预测PCa患者的存活率.因此,有必要探索PCa的免疫学特性.方法 首先,我们从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中检索了499个PCa和52个正常前列腺组织样本的RNA测序和临床数据.我们在PCa和正常前列腺组织之间鉴定了317个差异表达的免疫相关基因与1988个预后基因取交集,共纳入9个关键基因.对正常组和肿瘤组的9个差异基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.进一步获得差异表达基因中的免疫基因进行单变量和多变量Cox和Lasso回归分析,4个独立的免疫基因免疫球蛋白重变量7-81(Immunoglobulin Heavy Variable 7-81,IGHV7-81)、NADPH氧化酶1(NADPH oxidase 1,NOX1)、髓过氧化物酶(Myeloperoxidase,MPO)和骨形态发生蛋白7(Bone morphogenic protein 7,BMP7)与预后相关,用以建立免疫风险评分模型.结果 Kaplan-Meier结果显示IGHV7-81高表达提示预后不良,而NOX1和MPO低表达提示预后不良.结合多个临床信息和免疫风险评分(immune risk score signature,IRSS)相关免疫基因的列线图在预测结果方面比单个独立预后因素更有效.我们成功构建并验证了免疫相关的PCa预测模型.该模型可以独立预测PCa患者的生存率.其中高免疫风险患者与PCa不良预后相关.进一步临床标本验证证实了免疫基因BMP7的低表达与PCa患者不良预后相关.结论 总体而言,我们检测到4个关键基因(IGHV7-81、NOX1、MPO和BMP7)可用作独立预测PCa的预后因素.其中临床标本免疫组化的验证表示BMP7在PCa患者中具有较好的预测能力.
文献关键词:
前列腺肿瘤;预后;生物标记;免疫;基因
作者姓名:
胡江生;万顺
作者机构:
湖北民族大学附属民大医院泌尿外科 湖北恩施 445000;兰州大学第二医院泌尿外科 甘肃兰州 730000
文献出处:
引用格式:
[1]胡江生;万顺-.前列腺癌相关免疫基因预后生物标志物的筛选研究)[J].中国男科学杂志,2022(05):20-29
A类:
IGHV7,IRSS
B类:
前列腺癌,相关免疫,免疫基因,预后生物标志物,Prostatic,Cancer,PCa,老年男性,目前为止,免疫学特性,癌症基因组图谱,cancer,genome,atlas,TCGA,前列腺组织,临床数据,免疫相关基因,预后基因,交集,关键基因,差异基因,基因本体论,Ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,富集分析,差异表达基因,多变量,Cox,Lasso,免疫球蛋白,Immunoglobulin,Heavy,Variable,NADPH,NOX1,髓过氧化物酶,Myeloperoxidase,MPO,骨形态发生蛋白,Bone,morphogenic,protein,BMP7,风险评分模型,Kaplan,Meier,预后不良,低表达,临床信息,immune,risk,score,signature,列线图,独立预后因素,不良预后,临床标本,总体而言,免疫组化,预测能力,前列腺肿瘤,生物标记
AB值:
0.357614
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