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核桃JrPUBs(U-box)基因家族鉴定与响应冷温胁迫基因筛选
文献摘要：
为了解析核桃U-box基因家族在冷胁迫中的生物学功能,本文通过生物信息学在核桃全基因组中挖掘U-box(JrPUBs)成员,并对该家族成员进行分析,结合转录组数据筛选响应冷胁迫的差异表达基因,并分析该差异基因在不同组织中的转录水平差异.结果表明:在核桃(Juglans regia)全基因组中鉴定出55个JrPUBs基因,编码55条蛋白序列;聚类分析发现,核桃U-box家族成员分为2个亚组;冷胁迫下获得15个差异表达基因,其中JrPUB7、JrPUB9、JrPUB17、JrPUB18、JrPUB20、JrPUB21在根中转录水平较高;JrPUB42和JrPUB48在老叶中转录水平较高.推测该家族15个成员可能响应冷胁迫并参与植物器官发育的调控.
文献关键词：
核桃;U-box基因家族;低温胁迫;基因筛选
中图分类号：
作者姓名：
姬新颖;冯启科;刘志月;刘凯;张俊佩;王红霞
作者机构：
中国林业科学研究院林业研究所/国家林业和草原局林木培育重点实验室,北京 100091;河北农业大学山区研究所/河北省山区农业技术创新中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北 保定071000;河北农业大学 园艺学院,河北保定 071000
文献出处：
引用格式：
[1]姬新颖;冯启科;刘志月;刘凯;张俊佩;王红霞-.核桃JrPUBs(U-box)基因家族鉴定与响应冷温胁迫基因筛选)[J].河北农业大学学报,2022(06):68-80
A类：
JrPUBs,JrPUB7,JrPUB9,JrPUB17,JrPUB18,JrPUB20,JrPUB21,JrPUB42,JrPUB48
B类：
核桃,box,基因家族鉴定,基因筛选,冷胁迫,生物学功能,全基因组,转录组数据,数据筛选,差异表达基因,差异基因,不同组织,转录水平,Juglans,regia,老叶,植物器官,器官发育,低温胁迫
AB值：
0.219182
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