典型文献
基于生物信息分析筛选甲状腺乳头状癌致病风险基因
文献摘要：
从基因表达总数据库中下载4组甲状腺乳头状癌基因芯片数据集,利用GEO2R软件筛选出164个差异性表达基因(DEGs),通过Metascape和STRING软件对DEGs进行生物学功能分析和蛋白质互作网络图构建.富集分析显示DEGs与癌症中的细胞外基质-受体、蛋白质的消化吸收以及MAPK信号传导途径等有密切关系.利用Cytoscape软件筛选出13个关键基因,采用GEPIA、UALCAN等数据库对关键基因进行双重验证及生存分析后,发现COMP和APOE影响总体生产率,TIMP1、LGALS3、KAT19、APOE可能与甲状腺肿瘤细胞的淋巴结转移相关,提示这些基因可能成为预后分子生物标志物和潜在的靶向基因治疗目标.
文献关键词：
甲状腺乳头状癌;生物信息学分析;关键基因;生物标志物
中图分类号：
作者姓名：
张芝;任医群;牛彦强;杨大雄;任建伟;周祖邦
作者机构：
甘肃中医药大学第一临床医学院,兰州730000;甘肃省人民医院超声医学科,兰州730000
文献出处：
引用格式：
[1]张芝;任医群;牛彦强;杨大雄;任建伟;周祖邦-.基于生物信息分析筛选甲状腺乳头状癌致病风险基因)[J].兰州大学学报（自然科学版）,2022(06):847-852
A类：
KAT19
B类：
生物信息分析,甲状腺乳头状癌,致病风险,风险基因,下载,癌基因,基因芯片,GEO2R,差异性表达,表达基因,DEGs,Metascape,STRING,生物学功能分析,蛋白质互作网络,网络图,富集分析,细胞外基质,消化吸收,MAPK,信号传导,传导途径,密切关系,Cytoscape,关键基因,GEPIA,UALCAN,生存分析,COMP,APOE,TIMP1,LGALS3,甲状腺肿瘤,肿瘤细胞,淋巴结转移,移相,生物标志物,基因治疗,治疗目标,生物信息学分析
AB值：
0.422898
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