典型文献
一株雀纹天蛾核型多角体病毒的鉴定及其基因组序列分析
文献摘要：
从自然死亡的雀纹天蛾幼虫分离到一株雀纹天蛾核型多角体病毒.通过扫描及切片透射电镜发现,该病毒为单粒包埋型核型多角体病毒,命名为ThjaSNPV(Theretra japonica single nucleopolyhedrovirus).病毒全基因组重测序后拼接显示,该病毒基因组全长134 899 bp,GC含量37.28％,与豆天蛾单粒包埋型核型多角体病毒株DZ1基因组序列相似性高达96.24％.ThjaSNPV含有131个开放阅读框(ORF)其中55个为正链基因,76个为负链基因,与宿主同为天蛾科的豆天蛾单粒包埋型核型多角体基因组相比,雀纹天蛾单粒包埋型核型多角体病毒新注释到7个基因:chitin-binding protein(ORF9),ODV-E18(ORF11),-lef-11(ORF27),hypothetical protein(ORF41),lef-10(ORF42),pif-6(ORF66),P6.9(ORF88).ThjaSNPV 的 DNA 光裂酶基因(DNA photolyase,ORF53)中不具有豆天蛾NPV中的1 bp碱基的缺失,只编码一个大的完整DNA裂合酶.38个串联的核心基因的进化分析显示雀纹天蛾NPV与Alphabaculovirus group Ⅱ类群聚类在一起,且和豆天蛾NPV最为相似.
文献关键词：
雀纹天蛾单粒包埋型核型多角体病毒;基因组;DNA光裂酶;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
占智高;关丽梅;况文东;王金昌;陈俊晖;周溪;范兆军;邓菲;王君;靳亮
作者机构：
江西省科学院微生物研究所,南昌330029;中国科学院武汉病毒研究所,武汉430071
文献出处：
引用格式：
[1]占智高;关丽梅;况文东;王金昌;陈俊晖;周溪;范兆军;邓菲;王君;靳亮-.一株雀纹天蛾核型多角体病毒的鉴定及其基因组序列分析)[J].病毒学报,2022(03):694-704
A类：
ThjaSNPV,Theretra,雀纹天蛾单粒包埋型核型多角体病毒,ORF9,ORF11,lef,ORF27,ORF41,ORF42,pif,ORF66,ORF88,photolyase,ORF53,Alphabaculovirus
B类：
一株,基因组序列分析,自然死亡,幼虫,透射电镜,japonica,single,nucleopolyhedrovirus,全基因组重测序,拼接,病毒基因组,基因组全长,bp,豆天蛾,毒株,DZ1,开放阅读框,宿主,天蛾科,chitin,binding,protein,ODV,E18,hypothetical,P6,酶基因,碱基,裂合酶,核心基因,进化分析,group,类群,群聚
AB值：
0.249392
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