典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探究杞黄降糖胶囊治疗2型糖尿病的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨杞黄降糖胶囊治疗2型糖尿病的潜在作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和中药药材名称大全(The encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)检索杞黄降糖胶囊组方中药的活性成分;利用Pubchem数据库获取活性成分相关靶点.通过GeneCards数据库获取2型糖尿病相关靶点,将杞黄降糖胶囊活性成分对应靶点与糖尿病靶点导入Venn diagrams网站,绘制韦恩图,交集靶点即为杞黄降糖胶囊治疗T2DM的潜在靶点;将杞黄降糖胶囊活性成分与潜在靶点导入Cytoscape 3.7.2软件,构建"活性成分-潜在靶点"网络,并通过Tools模块内"Network Analyzer"模块进行分析筛选出关键化合物和靶点;将潜在靶点导入STRING数据库,获得相互作用关系,导入Cytoscape 3.7.2软件分析并构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络.将交集靶点导入Metascape进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;将KEGG通路富集分析得到的前20条信号通路及相关靶点和靶点对应的活性成分导入Cytoscape 3.7.2软件,构建杞黄降糖胶囊干预T2DM的"活性成分-重要靶点-关键通路"网络;使用AutoDock软件进行活性成分和核心靶点的分子对接.结果:获得杞黄降糖胶囊组方中药活性成分237个,相关靶点281个;T2DM靶点1362个,杞黄降糖胶囊治疗T2DM的潜在靶点155个."活性成分-潜在靶点"网络拓扑分析发现32个关键成分及49个关键靶点.GO功能富集分析共得到471个条目,其中生物过程248个,分子功能125个,细胞组分98个.KEGG通路富集分析共得到299条信号通路.分子对接发现,杞黄降糖胶囊中的活性可与核心靶点自发结合.结论:杞黄降糖胶囊可通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗2型糖尿病的作用.
文献关键词:
2型糖尿病;杞黄降糖胶囊;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
吉萌萌;于亚南;吴嘉瑞;刘骏;姜燕华;荆志伟
作者机构:
宁夏大学生命科学学院,宁夏 银川;中国中医科学院中医临床基础医学研究所,北京;北京中医药大学中药学院,北京
文献出处:
引用格式:
[1]吉萌萌;于亚南;吴嘉瑞;刘骏;姜燕华;荆志伟-.基于网络药理学和分子对接技术探究杞黄降糖胶囊治疗2型糖尿病的作用机制)[J].中医学报(英文),2022(03):131-141,后插3-后插4
A类:
杞黄降糖胶囊
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探究,对接方法,潜在作用,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,大全,encyclopedia,ETCM,组方,Pubchem,GeneCards,Venn,diagrams,韦恩图,交集靶点,即为,T2DM,潜在靶点,Cytoscape,Tools,Network,Analyzer,STRING,相互作用关系,蛋白相互作用,protein,interaction,PPI,Metascape,基因本体,ontology,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,genes,genomes,通路富集分析,AutoDock,核心靶点,中药活性成分,网络拓扑分析,关键成分,关键靶点,条目,生物过程,接发,囊中,发结,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.276057
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