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VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例
文献摘要:
在"计算机在化学中的应用"课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响.课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导学生从定性和定量的角度对多肽与水分子间的氢键相互作用机制进行解析,能够丰富教师课堂教学手段,深化学生宏微观探析、证据推理与模型认知的化学学科核心能力.
文献关键词:
VMD软件;氢键;径向分布函数;空间分布函数
中图分类号:
作者姓名:
郑舒琳;钟容臻;代亚楠;蔡开聪
作者机构:
福建师范大学化学与材料学院 福建省先进材料化工基础重点实验室 福建福州 350007;福建省理论与计算化学重点实验室 福建厦门 361005
文献出处:
引用格式:
[1]郑舒琳;钟容臻;代亚楠;蔡开聪-.VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例)[J].化学教育,2022(24):95-100
A类:
ALAD,空间分布函数
B类:
VMD,分子间相互作用,丙氨酸,二肽,水分子,氢键作用,多肽,分子结构,过程中将,有机化学,三维立体,动画,堂上,上机,定性和定量,氢键相互作用,相互作用机制,教学手段,宏微观,微观探析,证据推理与模型认知,化学学科,学科核心能力,径向分布函数
AB值:
0.377304
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